VK segments - Leader or V region exon
VL segments - Leader or V region exon
| The following is a catalogue of all mapped V gene segments and alleles which belong to
functional loci (the unmapped and non-functional sequences can be obtained by
browsing the entire V BASE database). All alignments,
numbering and loop regions (L1-L3, H1-H3) are according to structural criteria defined
by Chothia (see Chothia et al. (1992) J. Mol. Biol., 227, 776-798,
Tomlinson et al. (1995) EMBO J., 14, 4628-4638 and Williams
et al. (1996) J. Mol. Biol., 264, 220-232). The corresponding canonical
structure numbers are also given where known ('U' indicates that the canonical structure of
this loop is currently unknown). CDRs are according to Kabat et al. (1991) as described
in Sequences of Proteins of Immunological Interest. Amino acid sequences are given in
single letter code - underlines correspond to positions with allelic differences (see below).
Sequences are named according to accepted locus nomenclature for each segment.
For each segment one sequence is shown in full from the start codon to the last nucleotide before the V gene exon in the case of the leader sequence, from the beginning of the V gene exon (Residue 1 in FR1) to the last nucleotide/amino acid before the heptamer recombination signal sequence in the case of VH, VK and VL or from first nucleotide/amino acid after the heptamer to the last nucleotide/amino acid before splice site in the case of JH, JK and JL. The D segment alignment runs from the first nucleotide/amino acid after the 5' heptamer to the last nucleotide/amino acid before the 3' heptamer. The name of this 'prototype' sequence and its references are listed first for each segment in the allele table which follows the amino acid and nucleotide alignments. The names and references of any alleles of this segment are listed beneath the details of the prototype sequence. These allelic differences are underlined in the amino acid and nucleotide alignments.
|
-19 -10 -1
| | |
VH1 1-02 MDWTWRILFLVAAATGAHS
1-03 MDWTWRILFLVAAATGAHS
1-08 MDWTWRILFLVAAATSAHS
1-18 MDWTWSILFLVAAPTGAHS
1-24 MDCTWRILFLVAAATGTHA
1-45 MDWTWRILFLVAAATDAYS
1-46 MDWTWRVFCLLAVAPGAHS
1-58 MDWIWRILFLVGAATGAHS
VH2 2-05 MDTLCSTLLLLTIPSWVLS
2-26 MDTLCYTLLLLTTPSWVLS
VH3 3-07 MELGLSWVFLVAILEGVQC
3-09 MELGLSWIFLLAILKGVQC
3-11 MEFGLSWVFLVAIIKGVQC
3-13 MELGLSWVFLVAILEGVQC
3-15 MEFGLSWIFLAAILKGVQC
3-20 MEFGLSWVFLVAILKGVQC
3-21 MELGLRWVFLVAILEGVQC
3-23 MEFGLSWLFLVAILKGVQC
3-30 MEFGLSWVFLVALLRGVQC
3-33 MEFGLSWVFLVALLRGVQC
3-43 MEFGLSWVFLVAILKGVQC
3-48 MELGLCWVFLVAILEGVQC
3-49 MEFGLSWVFLVAILKGVQC
3-53 MEFWLSWVFLVAILKGVQC
3-64 MTEFGLSWVFLVAIFKGVQC
3-66 MEFGLSWVFLVAILKGVQC
3-72 MEFGLSWVFLVVILQGVQC
3-74 MEFGLSWVFLVAILKGVQC
VH4 4-04 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-28 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-31 MKHLWFFLLLVAAPRWVLP
4-34 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-39 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-59 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-61 MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
4-b MKHLWFFLLLVAAPRWVLS
VH5 5-51 MGSTAILALLLAVLQGVCS
5-a MGSTAILGLLLAVLQGVCA
VH6 6-01 MSVSFLIFLPVLGLPWGVLS
VH7 7-04 MDWTWRILFLVAAATGAHS
VH1 -19 -10 -1
| | |
M D W T W R I L F L V A A A T G A H S
1-02 ATG GAC TGG ACC TGG AGG ATC CTC TTC TTG GTG GCA GCA GCC ACA G/GA GCC CAC TCC
1-03 ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ./.T ... ... ...
1-08 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... A/.T ... ... ...
1-18 ... ... ... ... ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... C.A ... ./.T ... ... ...
1-24 ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ./.C A.. ... G..
1-45 ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./AT ... T.. ...
1-46 ... ... ... ... ... ... G.. T.. .G. ... C.. ..T .T. ..T C.. ./.T ..T ... ...
1-58 ... ... ... .TT ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ..G ... ./.T ... ... ...
VH2 -19 -10 -1
| | |
M D T L C S T L L L L T I P S W V L S
2-05 ATG GAC ACA CTT TGC TCC ACG CTC CTG CTG CTG ACC ATC CCT TCA T/GG GTC TTG TCC
2-26 ... ... ... ... ... .A. ..A ... ... ... ... ... .C. ... ..C ./.. ... ... ...
VH3 -19 -10 -1
| | |
M E L G L S W V F L V A I L E G V Q C
3-07 ATG GAA TTG GGG CTG AGC TGG GTT TTC CTT GTT GCT ATT TTA GAA G/GT GTC CAG TGT
3-09 ... ..G ... ..A ... ... ... A.. ... ... T.G ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-11 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. A.. ./.. ... ... ...
3-13 ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ./.. ... ... ...
3-15 ... ..G ..T ... ... ... ... A.. ... ... .C. ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-20 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-21 ... ... C.. ... ..C C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
3-23 ... ..G ..T ... ... ... ... C.. ..T ... ..G ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-30 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... AG. ./.. ... ... ...
3-33 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... C.. ... AG. ./.. ... ... ...
3-43 ... ..G ..T ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-48 ... ..G ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
3-49 ... ..G ..T ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ..A ...
3-53 ... ..G ..T T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-64 ATG .C. ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T A.. ./.. ... ... ...
3-66 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
3-72 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... C.. ./.. ... ... ...
3-74 ... ..G ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
VH4 -19 -10 -1
| | |
M K H L W F F L L L V A A P R W V L S
4-04 ATG AAA CAC CTG TGG TTC TTC CTC CTG CTG GTG GCA GCT CCC AGA T/GG GTC CTG TCC
4-28 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
4-31 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... C..
4-34 ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
4-39 ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ./.. ... ... ...
4-59 ... ... ..T ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
4-61 ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
4-b ... ..G ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
VH5 -19 -10 -1
| | |
M G S T A I L A L L L A V L Q G V C S
5-51 ATG GGG TCA ACC GCC ATC CTC GCC CTC CTC CTG GCT GTT CTC CAA G/GA GTC TGT TCC
5-a ... ... ... ... ... ... ..T .G. ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... G..
VH6 -20 -10 -1
| | |
M S V S F L I F L P V L G L P W G V L S
6-01 ATG TCT GTC TCC TTC CTC ATC TTC CTG CCC GTG CTG GGC CTC CCA TGG G/GT GTC CTG TCA
VH7 -19 -10 -1
| | |
M D W T W R I L F L V A A A T G A H S
7-04.1 ATG GAC TGG ACC TGG AGG ATC CTC TTC TTG GTG GCA GCA GCA ACA G/GT GCC CAC TCC
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes 1-02 VI-2(2)/1-1(3)/V35(1)/VI-2b(2) 1-03 VI-3b(2) VI-3(2) -3 GCC>GTC (A>V) 1-08 V1-8(43) 1-18 V1-18(43) 1-24 V1-24P(43) 1-45 V1-45(43)/7-2(3) 1-46 21-2(3)/3-1(3)/V1-46(43) HG3(7) -6 GCT>GCA, -3 GCT>GCC 1-58 V71-5(4) 1-69 No mapped leader sequence 1-e No mapped leader sequence 1-f No mapped leader sequence 2-05 VII-5(2)/VII-5b(2) 2-26 V2-26(43) 2-70 No mapped leader sequence 3-07 V3-7(43) 3-09 V3-9P(43) 3-11* 22-2B(3) V3-11(43) -7 ATT>ATA 3-13 13-2(3)/V3-13(43) 3-15 9-1(3) V3-15(43) -9 GCT>CCT (A>P) 3-20 V3-20(43) 3-21 V3-21(43) 3-23 VH26Chen(14)/VH26Rabbitts(23) V3-23(43) -7 ATT>AAA (I>K), -6 TTA>ATA (L>I) 3-30 1-9III(3)/hv3005(12)/V3-30(43) 3-30.3 No mapped leader sequence 3-30.5 No mapped leader sequence 3-33 V3-33(43) 3-43 V3-43(43) 3-48 V3-48(43) 3-49 V3-49(43) 3-53 V3-53(43) 3-64 V3-64(43) 3-66 8-1B(3) 3-72 12-2(3) 3-73 No mapped leader sequence 3-74 H11Rechavi(15) 3-d No mapped leader sequence 4-04 VIV-4(2) V79(18)VIV-4b(2) -11 CTG>CTC, -1 TCC>TCT 4-28 1-9II(3)/V12G-1(18)/hv4005(21) 4-30.1 No mapped leader sequence 4-30.2 No mapped leader sequence 4-30.4 No mapped leader sequence 4-31 V4-31(43) 4-34 V4-34(43) 4-39 V2-1(18) 4-59 V71-4(4) 4-61 V71-2(4) 4-b VHSP(19) 5-51 V5-51(43) VH251Shen(22) -9 CTG>CTA, -7 GTT>ATT (V>I), -1 TCC>GCC (S>A) 5-a VH32Humphries(26) 6-01 VH-VI(24)/6-1G1(3)/VH6(53) 7-04.1 VI-4.1b(2) * Non functional alleles which have insertions and/or deletions (not indicated in amino acid and nucleotide alignments) 3-11 hv3.3 (27)
H1 H2
----------- --------
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3
------------------------------ ------- -------------- ------------------- ---------------------------------
1 2 3 4 5 6 7 8 9
H1-H2 Locus 123456789012345678901234567890 1ab2345 67890123456789 012abc3456789012345 67890123456789012abc345678901234
VH1 1-3 1-02 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT G--YYMH WVRQAPGQGLEWMG WINP--NSGGTNYAQKFQG RVTMTRDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCAR
1-3 1-03 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT S--YAMH WVRQAPGQRLEWMG WINA--GNGNTKYSQKFQG RVTITRDTSASTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
1-3 1-08 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT S--YDIN WVRQATGQGLEWMG WMNP--NSGNTGYAQKFQG RVTMTRNTSISTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
1-2 1-18 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT S--YGIS WVRQAPGQGLEWMG WISA--YNGNTNYAQKLQG RVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCAR
1-U 1-24 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKVSGYTLT E--LSMH WVRQAPGKGLEWMG GFDP--EDGETIYAQKFQG RVTMTEDTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAT
1-3 1-45 QMQLVQSGAEVKKTGSSVKVSCKASGYTFT Y--RYLH WVRQAPGQALEWMG WITP--FNGNTNYAQKFQD RVTITRDRSMSTAYMELSSLRSEDTAMYYCAR
1-3 1-46 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFT S--YYMH WVRQAPGQGLEWMG IINP--SGGSTSYAQKFQG RVTMTRDTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCAR
1-3 1-58 QMQLVQSGPEVKKPGTSVKVSCKASGFTFT S--SAVQ WVRQARGQRLEWIG WIVV--GSGNTNYAQKFQE RVTITRDMSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAA
1-2 1-69 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS S--YAIS WVRQAPGQGLEWMG GIIP--IFGTANYAQKFQG RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
1-2 1-e QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS S--YAIS WVRQAPGQGLEWMG GIIP--IFGTANYAQKFQG RVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR
1-2 1-f EVQLVQSGAEVKKPGATVKISCKVSGYTFT D--YYMH WVQQAPGKGLEWMG LVDP--EDGETIYAEKFQG RVTITADTSTDTAYMELSSLRSEDTAVYYCAT
VH2 3-1/2-1 2-05 QITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLS TSGVGVG WIRQPPGKALEWLA LIY---WNDDKRYSPSLKS RLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCAHR
3-1 2-26 QVTLKESGPVLVKPTETLTLTCTVSGFSLS NARMGVS WIRQPPGKALEWLA HIF---SNDEKSYSTSLKS RLTISKDTSKSQVVLTMTNMDPVDTATYYCARI
3-1 2-70 QVTLKESGPALVKPTQTLTLTCTFSGFSLS TSGMRVS WIRQPPGKALEWLA RID---WDDDKFYSTSLKT RLTISKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARI
VH3 1-3 3-07 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YWMS WVRQAPGKGLEWVA NIKQ--DGSEKYYVDSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-3 3-09 EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFD D--YAMH WVRQAPGKGLEWVS GISW--NSGSIGYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKD
1-3 3-11 QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS D--YYMS WIRQAPGKGLEWVS YISS--SGSTIYYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-1 3-13 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YDMH WVRQATGKGLEWVS AIG---TAGDTYYPGSVKG RFTISRENAKNSLYLQMNSLRAGDTAVYYCAR
1-U 3-15 EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS N--AWMS WVRQAPGKGLEWVG RIKSKTDGGTTDYAAPVKG RFTISRDDSKNTLYLQMNSLKTEDTAVYYCTT
1-3 3-20 EVQLVESGGGVVRPGGSLRLSCAASGFTFD D--YGMS WVRQAPGKGLEWVS GINW--NGGSTGYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYHCAR
1-3 3-21 EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFS S--YSMN WVRQAPGKGLEWVS SISS--SSSYIYYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-3 3-23 EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YAMS WVRQAPGKGLEWVS AISG--SGGSTYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK
1-3 3-30 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFS S--YGMH WVRQAPGKGLEWVA VISY--DGSNKYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK
1-3 3-30.3 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFS S--YAMH WVRQAPGKGLEWVA VISY--DGSNKYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-3 3-30.5 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFS S--YGMH WVRQAPGKGLEWVA VISY--DGSNKYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK
1-3 3-33 QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFS S--YGMH WVRQAPGKGLEWVA VIWY--DGSNKYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-3 3-43 EVQLVESGGVVVQPGGSLRLSCAASGFTFD D--YTMH WVRQAPGKGLEWVS LISW--DGGSTYYADSVKG RFTISRDNSKNSLYLQMNSLRTEDTALYYCAKD
1-3 3-48 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YSMN WVRQAPGKGLEWVS YISS--SSSTIYYADSVKG RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRDEDTAVYYCAR
1-U 3-49 EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGFTFG D--YAMS WFRQAPGKGLEWVG FIRSKAYGGTTEYTASVKG RFTISRDGSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCTR
1-1 3-53 EVQLVETGGGLIQPGGSLRLSCAASGFTVS S--NYMS WVRQAPGKGLEWVS VIY---SGGSTYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-3 3-64 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YAMH WVRQAPGKGLEYVS AISS--NGGSTYYANSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMGSLRAEDMAVYYCAR
1-1 3-66 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTVS S--NYMS WVRQAPGKGLEWVS VIY---SGGSTYYADSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-4 3-72 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS D--HYMD WVRQAPGKGLEWVG RTRNKANSYTTEYAASVKG RFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCAR
1-4 3-73 EVQLVESGGGLVQPGGSLKLSCAASGFTFS G--SAMH WVRQASGKGLEWVG RIRSKANSYATAYAASVKG RFTISRDDSKNTAYLQMNSLKTEDTAVYYCTR
1-3 3-74 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS S--YWMH WVRQAPGKGLVWVS RINS--DGSSTSYADSVKG RFTISRDNAKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR
1-6 3-d EVQLVESRGVLVQPGGSLRLSCAASGFTVS S--NEMS WVRQAPGKGLEWVS SI----SGGSTYYADSRKG RFTISRDNSKNTLHLQMNSLRAEDTAVYYCKK
VH4 2-1/1-1 4-04 QVQLQESGPGLVKPSGTLSLTCAVSGGSIS SS-NWWS WVRQPPGKGLEWIG EIY---HSGSTNYNPSLKS RVTISVDKSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
2-1 4-28 QVQLQESGPGLVKPSDTLSLTCAVSGYSIS SS-NWWG WIRQPPGKGLEWIG YIY---YSGSTYYNPSLKS RVTMSVDTSKNQFSLKLSSVTAVDTAVYYCAR
3-1 4-30.1 QVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGGSIS SGGYYWS WIRQHPGKGLEWIG YIY---YSGSTYYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
3-1 4-30.2 QLQLQESGSGLVKPSQTLSLTCAVSGGSIS SGGYSWS WIRQPPGKGLEWIG YIY---HSGSTYYNPSLKS RVTISVDRSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
3-1 4-30.4 QVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGGSIS SGDYYWS WIRQPPGKGLEWIG YIY---YSGSTYYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
3-1 4-31 QVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGGSIS SGGYYWS WIRQHPGKGLEWIG YIY---YSGSTYYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
1-1 4-34 QVQLQQWGAGLLKPSETLSLTCAVYGGSFS G--YYWS WIRQPPGKGLEWIG EIN---HSGSTNYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
3-1 4-39 QLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIS SSSYYWG WIRQPPGKGLEWIG SIY---YSGSTYYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
1-1 4-59 QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSIS S--YYWS WIRQPPGKGLEWIG YIY---YSGSTNYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
3-1 4-61 QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSVS SGSYYWS WIRQPPGKGLEWIG YIY---YSGSTNYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
2-1 4-b QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCAVSGYSIS SG-YYWG WIRQPPGKGLEWIG SIY---HSGSTYYNPSLKS RVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCAR
VH5 1-2 5-51 EVQLVQSGAEVKKPGESLKISCKGSGYSFT S--YWIG WVRQMPGKGLEWMG IIYP--GDSDTRYSPSFQG QVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCAR
1-2 5-a EVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGYSFT S--YWIS WVRQMPGKGLEWMG RIDP--SDSYTNYSPSFQG HVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCAR
VH6 3-5 6-01 QVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSVS SNSAAWN WIRQSPSRGLEWLG RTYYR-SKWYNDYAVSVKS RITINPDTSKNQFSLQLNSVTPEDTAVYYCAR
VH7 1-2 7-4.1 QVQLVQSGSELKKPGASVKVSCKASGYTFT S--YAMN WVRQAPGQGLEWMG WINT--NTGNPTYAQGFTG RFVFSLDTSVSTAYLQICSLKAEDTAVYYCAR
H1
----------------------------
CDR1
-------------------
VH1 10 20 30 40
| | | |
Q V Q L V Q S G A E V K K P G A S V K V S C K A S G Y T F T G Y Y M H W V R Q A P G Q G L E W M G
1-02 CAG GTG CAG CTG GTG CAG TCT GGG GCT GAG GTG AAG AAG CCT GGG GCC TCA GTG AAG GTC TCC TGC AAG GCT TCT GGA TAC ACC TTC ACC GGC TAC TAT ATG CAC TGG GTG CGA CAG GCC CCT GGA CAA GGG CTT GAG TGG ATG GGA
1-03 ... ..C ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T A.. ..T GC. ... ..T ... ... ..C ... ... ..C ... ... A.. ... ... ... ... ...
1-08 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.T ..T G.. ..C A.. ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ...
1-18 ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... A.. ..T GG. ..C AG. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
1-24 ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ..C ... ... ... C.. ..T .AA .TA .CC ... ... ... ... ... ... ..T ... ... A.. ... ... ... ... ... ...
1-45 ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... T.. ... ... ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... TA. CG. ..C C.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... .C. ... ... ... ... ...
1-46 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
1-58 ..A A.. ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ..T ..T A.. .CT GC. G.. ..G ... ... ... ... ..T .G. ... ... C.C ... ... ... ..A ...
1-69 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... GG. ... ... .G. A.. ..T GC. ..C AG. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
1-e ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... GG. ... ... .G. A.. ..T GC. ..C AG. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
1-f G.. ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T A.. ... ..A A.. ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... .A. ... ..C ... ... ... ... .A. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ...
H2
-----------------------
CDR2
-------------------------------------------------------------------
50 52 52a 53 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | | | | |
W I N P N S G G T N Y A Q K F Q G R V T M T R D T S I S T A Y M E L S R L R S D D T A V Y Y C A R
1-02 TGG ATC AAC CCT AAC AGT GGT GGC ACA AAC TAT GCA CAG AAG TTT CAG GGC AGG GTC ACC ATG ACC AGG GAC ACG TCC ATC AGC ACA GCC TAC ATG GAG CTG AGC AGG CTG AGA TCT GAC GAC ACG GCC GTG TAT TAC TGT GCG AGA GA
1-03 ... ... ... G.. GG. .A. ... AA. ... ..A ... T.. ... ... ..C ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ..A ... GCG ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..
1-08 ... ..G ... ... ... ... ... AA. ... GG. ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... A.. ..C ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G
1-18 ... ... .G. G.. T.. .A. ... AA. ... ... ... ... ... ... C.C ... ... ..A ... ... ... ... .CA ... ..A ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
1-24 G.T T.T G.T ... G.A GA. ... .AA ... .T. ..C ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... GA. ... ..A ..T .CA GA. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..
1-45 ... ... .CA ... TT. .A. ... AA. ..C ... ..C ... ... ..A ..C ... .A. ..A ... ... ..T ... ... ... .G. ..T ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ..A ... A.. ... ... ... ..A ... T.
1-46 ATA ... ... ... .GT G.. ... A.. ... .G. ..C ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... .CG ... ... .T. ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
1-58 ... ... GT. GT. GG. ... ... AA. ... ... ..C ... ... ... ..C ... .AA ..A ... ... ..T ... ... ... .T. ... .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... ... ... GC. ..
1-69 G.. ... .T. ... .T. TT. ... ACA G.. ... ..C ... ... ... ..C ... ... ..A ... ..G ..T ... GC. ... GAA ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
1-e G.. ... .T. ... .T. TT. ... ACA G.. ... ..C ... ... ... ..C ... ... ..A ... ..G ..T ... GC. ... .AA ... .CG ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
1-f CTT G.T G.T ... G.A GA. ... .AA ... .TA ..C ... G.. ... ..C ... ... ..A ... ... ..A ... GC. ... ... ..T .CA GA. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ..
H1
------------------------------------
CDR1
---------------------------
VH2 10 20 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | |
Q I T L K E S G P T L V K P T Q T L T L T C T F S G F S L S T S G V G V G W I R Q P P G K A L E W L A
2-05 CAG ATC ACC TTG AAG GAG TCT GGT CCT ACG CTG GTG AAA CCC ACA CAG ACC CTC ACG CTG ACC TGC ACC TTC TCT GGG TTC TCA CTC AGC ACT AGT GGA GTG GGT GTG GGC TGG ATC CGT CAG CCC CCA GGA AAG GCC CTG GAG TGG CTT GCA
2-26 ... G.. ... ... ... ... ... ... ... GT. ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... .A. GC. A.. A.. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ...
2-70 ... G.. ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. C.. ... A.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ...
H2
-------------------
CDR2
---------------------------------------------------------------
50 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | |
L I Y W N D D K R Y S P S L K S R L T I T K D T S K N Q V V L T M T N M D P V D T A T Y Y C A H R
2-05 CTC ATT TAT TGG AAT GAT GAT AAG CGC TAC AGC CCA TCT CTG AAG AGC AGG CTC ACC ATC ACC AAG GAC ACC TCC AAA AAC CAG GTG GTC CTT ACA ATG ACC AAC ATG GAC CCT GTG GAC ACA GCC ACA TAT TAC TGT GCA CAC AGA C
2-26 .A. ... .T. .C. ... ..C ..A ..A TC. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .GG .T. .
2-70 .G. ... G.. ... G.. ... ... ..A TT. ... ... A.. ... ... ... .C. ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... .GG .T. .
H1
----------------------------
CDR1
-------------------
VH3 10 20 30 40
| | | |
E V Q L V E S G G G L V Q P G G S L R L S C A A S G F T F S S Y W M S W V R Q A P G K G L E W V A
3-07 GAG GTG CAG CTG GTG GAG TCT GGG GGA GGC TTG GTC CAG CCT GGG GGG TCC CTG AGA CTC TCC TGT GCA GCC TCT GGA TTC ACC TTT AGT AGC TAT TGG ATG AGC TGG GTC CGC CAG GCT CCA GGG AAG GGG CTG GAG TGG GTG GCC
3-09 ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..C A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GA. GAT ... GCC ... CA. ... ... ..G ..A ... ... ... ... ..C ... ... ... ..C T.A
3-11 C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... GA. ..C .AC ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.A
3-13 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C GAC ... CA. ... ... ... ..A ... A.. ..A ..A ..T ... ... ... ..C T.A
3-15 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A A.. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... .A. GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T .G.
3-20 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. ..A .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GA. GAT ... G.C ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.T
3-21 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.C ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A
3-23 ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A
3-30 C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... G.C ... CA. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A
3-30.3 C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... GCT ... CA. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A
3-30.5 C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... G.C ... CA. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A
3-33 C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ..C ... ... ... G.C ... CA. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A
3-43 ..A ... ... ... ... ... ... ... ... .T. G.. ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... GA. GAT ... ACC ... CA. ... ... ..T ..A ... ..G ... ... ..T ... ... ... ..C T.T
3-48 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... A.C ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.A
3-49 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A ... C.. ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ... ... ... ... G.. GAT ... GCT ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .GT
3-53 ... ... ... ... ... ... A.. ..A ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... G.C ... ... A.C .AC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A
3-64 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... GCT ... CA. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..A .AT ..T T.A
3-66 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.C ... ... A.C .AC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C T.A
3-72 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... GA. C.C .AC ... GA. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T .G.
3-73 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... G.. .C. GCT ... CA. ... ... ... ... ... T.C ... ..A ... ... ... ... ..T .G.
3-74 ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ..A ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..C ... ... CA. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... .T. ... ..C T.A
3-d ... ... ... ... ... ... ... C.. ... .T. ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.C ... ... A.. GA. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ..C T.A
H2
-------------------------------
CDR2
---------------------------------------------------------------------------
50 52 52a 52b 52c 53 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | | | | | | |
N I K Q D G S E K Y Y V D S V K G R F T I S R D N A K N S L Y L Q M N S L R A E D T A V Y Y C A R
3-07 AAC ATA AAG CAA --- --- GAT GGA AGT GAG AAA TAC TAT GTG GAC TCT GTG AAG GGC CGA TTC ACC ATC TCC AGA GAC AAC GCC AAG AAC TCA CTG TAT CTG CAA ATG AAC AGC CTG AGA GCC GAG GAC ACG GCT GTG TAT TAC TGT GCG AGA GA
3-09 GGT ..T .GT TGG --- --- A.. A.T G.. AGC .T. GG. ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..T ... ... ... ..C T.. ... ... ... ..A .A. ..T A
3-11 T.. ..T .GT AGT --- --- AG. ..T ... ACC .T. ... ..C .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..
3-13 GCT ..T GGT --- --- --- AC. .CT G.. ..C .C. ... ... CCA .G. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ..T ... ... ... ..C T.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..
3-15 CGT ..T ..A AGC AAA ACT ... ..T G.G ACA .C. G.. ..C .CT .CA C.C ... ..A ... A.. ... ... ... ..A ... ..T G.T T.A ..A ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... .A. A.. ... ... ..A ..C ... ... ... ... A.C .C. ..
3-20 GGT ..T ..T TGG --- --- A.. ..T G.. AGC .C. GGT ... .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..C T.. ... C.. ... ... ... ..
3-21 TC. ..T .GT AGT --- --- AG. A.T ... T.C .T. ... ..C .CA ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
3-23 GCT ..T .GT GGT --- --- AG. ..T G.. AGC .C. ... ..C .CA ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... .A. ..
3-30 GTT ... TCA T.T --- --- ... ... ... A.T ... ... ... .CA ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..
3-30.3 GTT ... TCA T.T --- --- ... ... ..C A.T ... ... ..C .CA ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
3-30.5 GTT ... TCA T.T --- --- ... ... ... A.T ... ... ... .CA ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..
3-33 GTT ... TG. T.T --- --- ... ... ... A.T ... ... ... .CA ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
3-43 CTT ..T .GT TGG --- --- ... ..T G.. AGC .C. ... ... .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... AG. ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ... ... A.T ... ... ..C ..C T.. ... ... ... ..A .A. ..T A
3-48 T.. ..T .GT AGT --- --- AG. A.T ... ACC .T. ... ..C .CA ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
3-49 TT. ..T .GA AGC AAA GCT T.. ..T G.G ACA .C. G.A ..C ACC .CG ... ... ..A ... A.. ... ... ... ..A ... ..T GGT T.. ..A .G. ATC GCC ... ... ... ... ... ... ... .A. A.. ... ... ..A ..C ... ... ... ... A.T ... ..
3-53 GTT ..T T.T --- --- --- AGC ..T G.. AGC .C. ... ..C .CA ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..
3-64 GCT ..T .GT AGT --- --- A.. ..G G.. AGC .C. ..T ... .CA A.. ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ..T ... ... GG. ... ... ... ..T ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..
3-66 GTT ..T T.T --- --- --- AGC ..T G.. AGC .C. ... ..C .CA ... ..C ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
3-72 CGT .CT .GA A.C AAA GCT A.C A.T TAC ACC .C. G.A ..C .CC .CG ... ... ..A ... A.. ... ... ... ..A ... ..T G.T T.A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. A.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ..
3-73 CGT ..T .GA AGC AAA GCT A.C A.T TAC .C. .C. GCA ... .CT .CG ..G ... ..A ... A.G ... ... ... ... ... ..T G.T T.A ... ... A.G GC. ... ... ... ... ... ... ... .A. A.. ... ... ... ..C ... ... ... ... A.T ... C.
3-74 CGT ..T ..T AGT --- --- ... ..G ... AGC .C. AG. ..C .C. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ..
3-d TC. ..T --- --- --- --- AG. ..T G.. AGC .C. ... ..C .CA ... ..C AG. ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T T.. ... ... A.G ... C.. ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... AA. .A. ..
H1
------------------------------------
CDR1
---------------------------
VH4 10 20 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | |
Q V Q L Q E S G P G L V K P S G T L S L T C A V S G G S I S S S N W W S W V R Q P P G K G L E W I G
4-04 CAG GTG CAG CTG CAG GAG TCG GGC CCA GGA CTG GTG AAG CCT TCG GGG ACC CTG TCC CTC ACC TGC GCT GTC TCT GGT GGC TCC ATC AGC AGT AGT --- AAC TGG TGG AGT TGG GTC CGC CAG CCC CCA GGG AAG GGG CTG GAG TGG ATT GGG
4-28 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... TA. ... ... ... ... ... --- ... ... ... G.C ... A.. ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ...
4-30.1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A CA. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... G.. GGT T.. .AC ... ..C ... A.. ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ...
4-30.2 ... C.. ... ... ... ... ..C ... T.. ... ... ... ... ... ..A CA. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. GGT T.. .CC ... ..C ... A.. ..G ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ... ...
4-30.4 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A CA. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... G.. GAT T.. .AC ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ...
4-31 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A CA. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... G.. GGT T.. .AC ... ..C ... A.. ... ... .A. ... ... ... ..C ... ... ... ... ...
4-34 ... ... ... ..A ... C.. .G. ... G.. ... ... T.. ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ..G ... T.. ..T G.. --- --- T.. .AC ... ..C ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
4-39 ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... AGT T.. .AC ... G.C ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
4-59 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..T ... --- --- T.. .AC ... ..C ... A.. ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ...
4-61 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... G.. ... ... G.. AGT T.. .AC ... ..C ... A.. ..G ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ...
4-b ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... TA. ... ... ... ... G.. --- T.. .AC ... G.C ... A.. ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
H2
-------------------
CDR2
---------------------------------------------------------------
50 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | |
E I Y H S G S T N Y N P S L K S R V T I S V D K S K N Q F S L K L S S V T A A D T A V Y Y C A R
4-04 GAA ATC TAT CAT AGT GGG AGC ACC AAC TAC AAC CCG TCC CTC AAG AGT CGA GTC ACC ATA TCA GTA GAC AAG TCC AAG AAC CAG TTC TCC CTG AAG CTG AGC TCT GTG ACC GCC GCG GAC ACG GCC GTG TAT TAC TGT GCG AGA GA
4-28 T.C ... ... T.. ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.
4-30.1 T.C ... ... T.C ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .C. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
4-30.2 T.C ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..
4-30.4 T.C ... ... T.C ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..
4-31 T.C ... ... T.C ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... .C. ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
4-34 ... ... A.. ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ..
4-39 AGT ... ... T.. ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... ... C.
4-59 T.T ... ... T.C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
4-61 T.T ... ... T.C ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
4-b AGT ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
H1
----------------------------
CDR1
-------------------
VH5 10 20 30 40
| | | |
E V Q L V Q S G A E V K K P G E S L K I S C K G S G Y S F T S Y W I G W V R Q M P G K G L E W M G
5-51 GAG GTG CAG CTG GTG CAG TCT GGA GCA GAG GTG AAA AAG CCC GGG GAG TCT CTG AAG ATC TCC TGT AAG GGT TCT GGA TAC AGC TTT ACC AGC TAC TGG ATC GGC TGG GTG CGC CAG ATG CCC GGG AAA GGC CTG GAG TGG ATG GGG
5-a ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
H2
-----------------------
CDR2
-------------------------------------------------------------------
50 52 52a 53 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | | | | |
I I Y P G D S D T R Y S P S F Q G Q V T I S A D K S I S T A Y L Q W S S L K A S D T A M Y Y C A R
5-51 ATC ATC TAT CCT GGT GAC TCT GAT ACC AGA TAC AGC CCG TCC TTC CAA GGC CAG GTC ACC ATC TCA GCC GAC AAG TCC ATC AGC ACC GCC TAC CTG CAG TGG AGC AGC CTG AAG GCC TCG GAC ACC GCC ATG TAT TAC TGT GCG AGA CA
5-a .GG ..T G.. ... A.. ... ... T.. ... .AC ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
H1
------------------------------------
CDR1
---------------------------
VH6 10 20 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | |
Q V Q L Q Q S G P G L V K P S Q T L S L T C A I S G D S V S S N S A A W N W I R Q S P S R G L E W L G
6-1 CAG GTA CAG CTG CAG CAG TCA GGT CCA GGA CTG GTG AAG CCC TCG CAG ACC CTC TCA CTC ACC TGT GCC ATC TCC GGG GAC AGT GTC TCT AGC AAC AGT GCT GCT TGG AAC TGG ATC AGG CAG TCC CCA TCG AGA GGC CTT GAG TGG CTG GGA
H2
---------------------------
CDR2
-----------------------------------------------------------------------
50 52 52a 52b 53 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | | | | | |
R T Y Y R S K W Y N D Y A V S V K S R I T I N P D T S K N Q F S L Q L N S V T P E D T A V Y Y C A R
6-1 AGG ACA TAC TAC AGG TCC AAG TGG TAT AAT GAT TAT GCA GTA TCT GTG AAA AGT CGA ATA ACC ATC AAC CCA GAC ACA TCC AAG AAC CAG TTC TCC CTG CAG CTG AAC TCT GTG ACT CCC GAG GAC ACG GCT GTG TAT TAC TGT GCA AGA GA
H1
----------------------------
CDR1
-------------------
VH7 10 20 30 40
| | | |
Q V Q L V Q S G S E L K K P G A S V K V S C K A S G Y T F T S Y A M N W V R Q A P G Q G L E W M G
7-4.1 CAG GTG CAG CTG GTG CAA TCT GGG TCT GAG TTG AAG AAG CCT GGG GCC TCA GTG AAG GTT TCC TGC AAG GCT TCT GGA TAC ACC TTC ACT AGC TAT GCT ATG AAT TGG GTG CGA CAG GCC CCT GGA CAA GGG CTT GAG TGG ATG GGA
H2
-----------------------
CDR2
-------------------------------------------------------------------
50 52 52a 53 60 70 80 82 82a 82b 82c 83 90
| | | | | | | | | | | | |
W I N T N T G N P T Y A Q G F T G R F V F S L D T S V S T A Y L Q I C S L K A E D T A V Y Y C A R
7-4.1 TGG ATC AAC ACC AAC ACT GGG AAC CCA ACG TAT GCC CAG GGC TTC ACA GGA CGG TTT GTC TTC TCC TTG GAC ACC TCT GTC AGC ACG GCA TAT CTG CAG ATC TGC AGC CTA AAG GCT GAG GAC ACT GCC GTG TAT TAC TGT GCG AGA GA
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes 1-02 DP-75(51)/VI-2(2) 1-1(3) 14 CCT>CTT (P>L) DP-8(34) 66 AGG>TGG (R>W) V35(1)/VI-2b(2) 50 TGG>CGG (W>R), 69 ATG>AGT (M>S), 88 GCC>GTC (A>V) 1-03 DP-25(34)/VI-3b(2) VI-3(2) 2 GTC>GTT, 4 CTT>CTG, 51 ATC>AGC (I>S), 62 AAG>GAG (K>E), 85 GAA>GAG, 87 ACG>ATG (T>M) 1-08 DP-15(34)/V1-8(43) 1-18 DP-14(34)/V1-18(43) 1-24 DP-5(34)/V1-24P(43) 1-45* DP-4(34) 7-2(3) 70 ACC>ACT COS-5(51) 42 GGA>AGA (G>R) 1-46* DP-7(34)/21-2(3)/3-1(3) HG3(7) 30 ACC>AAC (T>N) 1-58 DP-2(34)/V71-5(4) 1-69 DP-10(34)/DA-6(48) YAC-7(48) 2 GTG>GTC, 6 CAG>CAA, 33 GCT>ACT (A>T), 50 GGG>AGG (G>R), 54 TTT>CTT (F>L), 56 ACA>ATA (T>I), 73 GAA>AAA (E>K) 1-e DP-88(51) DA-2(48) 50 GGG>AGG (G>R), 73 AAA>GAA (K>E) 1-f DP-3(34) DA-1(48) 59 TAC>TAT 2-05 VII-5(2) [H1 canonical structure 3] VII-5b(2) [H1 canonical structure 2] 31b GGA>--- (G>-), 32 GTG>GAG (V>E), 33 GGT>TGG (G>W), 34 GTG>TGT (V>C), 54 AAT>GAT (N>D) DP-76(51) [H1 canonical structure 3] 54 AAT>GAT (N>D) 2-26 V2-26(43)/DP-26(34) 2-70 DP-28(34)/DA-7(48) DP-27(34) 5 AAG>AGG (K>R), 33 CGT>TGT (R>C), 50 CGC>CTC (R>L), 58 TTC>TAC (F>Y) YAC-3(48) 34 GTG>GCG (V>A) 3-07 DP-54(34)/V3-7(43) 3-09 DP-31(34)/V3-9P(43) 3-11* DP-35(34)/V3-11(43)/22-2B(3) 3-13 DP-48(34)/13-2(3) V3-13(43) 3 CAG>CAT (Q>H), 17 TCC>GCC (S>A), 31 AGC>AAC (S>N), 50 GCT>GCC, 51 ATT>AAT (I>N), 65 GGC>GGG 3-15 DP-38(34)/9-1(3) V3-15(43) 10 GGC>GCC (G>A) 3-20 DP-32(34)/V3-20(43) 3-21 DP-77(51) V3-21(43) 3 CAG>CAA 3-23 DP-47(34)/V3-23(43)/VH26Chen(14) VH26Rabbitts(23) 60 GCA>GGA (A>G), 70 TCC>TCA 3-30 DP-49(34)/1-9III(3)/3d28(32) COS-3(51) 16 AGG>GGG (R>G), 24 GCC>GCG, 50 GTT>TTT (V>F), 52 TCA>CGG (S>R) COS-8(51) 33 GGC>GCT (G>A), 59 TAT>TAC, 94 AAA>AGA (K>R) hv3005(12)/3d24(32) 33 GGC>GCT (G>A), 45 CTG>CTA, 59 TAT>TAC, 94 AAA>AGA (K>R) V3-30(43) 94 AAA>AGA (K>R) 3-30.3 DP-46(34)/3d216(32) 3-30.5 DP-49(34) 3-33 DP-50(34)/3d277(32) V3-33(43) 2 GTG>GTA, 63 GTG>GCG (V>A), 75 AAG>ACG (K>T), 79 TAT>TTT (Y>F) 3-43 DP-33(34)/V3-43(43) COS-16(51) 10 GTC>GGC (V>G), 33 ACC>GCC (T>A), 41 CCG>CCA, 53 TGG>GGG (W>G) 3-48 DP-51(34) V3-48(43) 84 GAC>GCC (D>A) 3-49 V3-49(43) 3-53 DP-42(34) V3-53(43) 7 ACT>TCT (T>S) 3-64 V3-64(43)/YAC-6(48) DP-61(34) 61 AAC>GAC (N>D) 3-66 YAC-5(48) 8-1B(3) 66 AGA>CGA, 84 GCC>GCT DP-86(51)/DA-9(48) 54 GGT>TGT (G>C) 3-72 DP-29(34)/12-2(3) DA-3(48) 54 AGT>AGC 3-73 YAC-9(48)/COS-27(51)/DA-11(48) 3-74 DP-53(34)/VPVH(56)/DA-8(48) COS-6(51) 7 TCC>TCT H11Rechavi(15) 58 AGC>ACG (S>T) 3-d COS-12(51) 4-04 DP-70(34)/4d68(45) [H1 canonical structure 2] V79(18)VIV-4b(2) [H1 canonical structure 2] 15 TCG>CCG (S>P), 91 TAC>TGC (Y>C) VIV-4(2) [H1 canonical structure 1] 16 GGG>GAG (G>E), 23 GCT>ACT (A>T), 30 AGC>AGT, 31a AGT>--- (S>-), 32 AAC>TAC (N>Y), 33 TGG>TAC (W>Y), 35 AGT>AGC, 37 GTC>ATC (V>I), 38 CGC>CGG, 41 CCA>GCC (P>A), 44 GGG>GGA, 50 GAA>CGT (E>R), 53 CAT>ACC (H>T), 61 CCG>CCC, 69 ATA>ATG (I>M), 73 AAG>ACG (K>T) 4-28 DP-68(34)/1-9II(3)/3d28d(32)V12G-1(18) hv4005(21)/3d24d(32) 15 TCG>TCA, 16 GAC>CAG (D>Q), 57 ACC>ATC (T>I) 4-30.1 DP-65(34) 4-30.2 DP-64(34)/3d216d(32) 4-30.4 DP-78(51)/3d230d(45) 4-31 DP-65(34)/3d75d(45) 3d277d(32) 66 CGA>CTA (R>L) V4-31(43) 22 TGC>TGT 4-34 DP-63(34) V4-34(43) 5 CAG>CAA, 95 GA>GG VH5(10)/4d76(45) 95 GA>GG 4-39 DP-79(51)/4d154(45) V2-1(18) 77 CAG>CAC (Q>H), 95 CA>GA 4-59 DP-71(34)/3d197d(45) V71-4(4) 29 ATC>GTC (I>V) 4-61 DP-66(34)/V71-2(4) 3d279d(45) 15 TCG>TCA, 16 GAG>CAG (E>Q), 29 GTC>ATC (V>I), 41 CCA>GCC (P>A), 50 TAT>CGT (Y>R), 53 TAC>ACC (Y>T), 84 GCT>GCC, 85 GCG>GCA 4-b DP-67(34) VHSP(19)/VH-JA(20) 23 GCT>ACT (A>T) 5-51 DP-73(34)/V5-51(43)/VH251Sanz(17) COS-25(51) 42 GGG>AGG (G>R) VH251Shen(22) 34 ATC>ACC (I>T), 45 CTG>TTG COS-24(51) 14 CCC>CCG 5-a* VH32Sanz(17) 6-01 DP-74(34)/VH-VI(24)/6-1G1(3)/VH6(53) 7-04.1 DP-21(34)/4d275a(46) VI-4.1b(2) 82a TGC>AGC (C>S) * Non functional alleles which have insertions and/or deletions (not indicated in amino acid and nucleotide alignments) 1-45 V1-45 (43) 1-46 V1-46 (43) 3-11 hv3.3 (27) 5-a VH32Humphries (26)
-20 -10 -1
| | |
VKI O12 MDMRVPAQLLGLLLLWLRGARC
O2 MDMRVPAQLLGLLLLWLRGARC
O18 MDMRVPAQLLGLLQLWLSGARC
O8 MDMRVPAQLLGLLLLWLSGARC
A20 MDMRVPAQLLGLLLLWLPDTRC
A30 MDMRVPAQLLGLLLLWFPGARC
L14 MDMRVPAQLLGLLLLWFPGARC
L1 MDMRVLAQLLGLLLLCFPGARC
L15 MDMRVLAQLLGLLLLCFPGARC
L4 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L18 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L5 MDMRVPAQLLGLLLLWFPGSRC
L19 MDMRVPAQLLGLLLLWFPGSRC
L8 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L23 MDMRVPAQRLGLLLLWFPGARC
L9 MRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L24 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L11 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGARC
L12 MDMRVPAQLLGLLLLWLPGAKC
VKII O11 MRLPAQLLGLLMLWVPGSSE
O1 MRLPAQLLGLLMLWVPGSSE
A17 MRLPAQLLGLLMLWVPGSSG
A1 MRLPAQLLGLLMLWVPGSSG
A18 MRLPAQLLGLLMLWIPGSSA
A2 MRLPAQLLGLLMLWIPGSSA
A19 MRLPAQLLGLLMLWVSGSSG
A3 MRLPAQLLGLLMLWVSGSSG
A23 MRLLAQLLGLLMLWVPGSSG
VKIII A27 METPAQLLFLLLLWLPDTTG
A11 METPAQLLFLLLLWLPDTTG
L2 MEAPAQLLFLLLLWLPDTTG
L16 MEAPAQLLFLLLLWLPDTTG
L6 MEAPAQLLFLLLLWLPDTTG
L20 MEAPAQLLFLLLLWLTDTTG
L25 MEPWKPQHSFFFLLLLWLPDTTG
VKIV B3 MVLQTQVFISLLLWISGAYG
VKV B2 MGSQVHLLSFLLLWISDTRA
VKVI A26 MLPSQLIGFLLLWVPASRG
A10 MLPSQLIGFLLLWVPASRG
A14 MVSPLQFLRLLLLWVPASRG
VKI -20 -10 -1
| | |
M D M R V P A Q L L G L L L L W L R G A R C
O12 ATG GAC ATG AGG GTC CCC GCT CAG CTC CTG GGG CTC CTG CTA CTC TGG CTC CGA G/GT GCC AGA TGT
O2 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
O18 ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... .AG ... ... ... TC. ./.. ... ... ...
O8 ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... TC. ./.. ... ... ...
A20 ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ..A ... ... ..G ... ... ... .C. ./A. A.. ... ...
A30 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... T.. .C. ./.. ... ..G ...
L14 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... T.. .C. ./.. ... ... ...
L1 ... ... ... ..A ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T T.. .C. ./.. ... ... ...
L15 ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..T T.. .C. ./.. ... ... ...
L4 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L18 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L5 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... T.. .C. ./.. T.. ... ..C
L19 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... T.. .C. ./.. T.. ... ..C
L8 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L23 ... ... ... ... ..G ... ... ... .G. ... ... ... ... ..G ... ... T.. .C. ./.. ... ... ...
L9 ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L24 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L11 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... ... ...
L12 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... .C. ./.. ... .A. ...
VKII -20 -10 -1
| | |
M R L P A Q L L G L L M L W V P G S S E
O11 ATG AGG CTC CCT GCT CAG CTC CTG GGG CTG CTA ATG CTC TGG GTC CCT G/GA TCC AGT GAG
O1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
A17 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ./.. ... ... .G.
A1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ./.. ... ... .G.
A18 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ./.. ... ... .C.
A2 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.A ... ./.. ... ... .CA
A19 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ./.. ... ... .G.
A3 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ./.. ... ... .G.
A23 ... ... ... .T. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... .G.
VKIII -20 -10 -1
| | |
M E T P A Q L L F L L L L W L P D T T G
A27 ATG GAA ACC CCA GCG CAG CTT CTC TTC CTC CTG CTA CTC TGG CTC CCA G/AT ACC ACC GGA
A11 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
L2 ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ..T ...
L16 ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ..T ...
L6 ... ... G.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
L20 ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ./.. ... ... ...
L25 ATG GAA CCA TG. A.G C.. .AG CAC AGC T.C T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
VKIV -20 -10 -1
| | |
M V L Q T Q V F I S L L L W I S G A Y G
B3 ATG GTG TTG CAG ACC CAG GTC TTC ATT TCT CTG TTG CTC TGG ATC TCT G/GT GCC TAC GGG
VKV -20 -10 -1
| | |
M G S Q V H L L S F L L L W I S D T R A
B2 ATG GGG TCC CAG GTT CAC CTC CTC AGC TTC CTC CTC CTT TGG ATC TCT G/AT ACC AGG GCA
VKVI -19 -10 -1
| | |
M L P S Q L I G F L L L W V P A S R G
A26 ATG TTG CCA TCA CAA CTC ATT GGG TTT CTG CTG CTC TGG GTT CCA G/CC TCC AGG GGT
A10 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
A14 ATG G.. .CC ..G .TG ... T.. C.G C.. C.. ... ..C ... ... ... ... ./.. ... ... ...
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes O12 O12(88) V3b(88) -5 CGA>TGA (R>*) O2 O2(88) O18 O18(89) O18a(89) -9 CAG>CTG (Q>L) O8 O8(89) A20 A20(90) A30 A30(92) L14 L14(92) L1 HK137(68) L15 HK134(68)/HK166(68)/HK101(67)/HK146(68)/HK189(68) L4 Va'(71)/Va(71) L18 Va'(71)/Va''(73) L5 Vb(71) Vb'(71) -19 AGG>ATG (R>M) L19 Vb''(73) Vb'(71) -19 AGG>ATG (R>M) L8 Vd(71) L23 L23(92)/L23a(92) L9 Ve(71) L24 L24a(92)/V13(69) L11 L11(89) L12 HK102(67)/V1(69)/L12a(92) O11 O11(88) O1 O1(88) A17 A17(90) A1 A1(90) A18 A18b(110)/A18(90) A2 A2(85)/A2b(109)/A2c(110) A19 A19(90) A3 A3(81) A23 A23(81) A27 A27(81)/VKRF(humkv325)(77) A11 A11(81)/humkv305(75) L2 humkv328h5(84) L16 L16(92)/humkv328h2(84)/humkv328(84)/humkv329(84) L6 Vg(70) L20 Vg''(73) L25 L25(92) B3 VKIVKlobeck(72) B2 EV15(74) A26 A26(90) A10 A10(82) A14 A14(82)
L1 L2 L3
------------- --- -----
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3
----------------------- ----------------- --------------- ------- -------------------------------- -------
1 2 3 4 5 6 7 8 9
L1-L2-L3 Locus 12345678901234567890123 45678901abcdef234 567890123456789 0123456 78901234567890123456789012345678 9012345
VKI 2-1-(1) O12 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQSISS------YLN WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQSYSTP
2-1-(1) O2 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQSISS------YLN WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQSYSTP
2-1-(1) O18 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC QASQDISN------YLN WYQQKPGKAPKLLIY DASNLET GVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYC QQYDNLP
2-1-(1) O8 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC QASQDISN------YLN WYQQKPGKAPKLLIY DASNLET GVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYC QQYDNLP
2-1-(U) A20 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WYQQKPGKVPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYC QKYNSAP
2-1-(1) A30 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKRLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC LQHNSYP
2-1-(1) L14 NIQMTQSPSAMSASVGDRVTITC RARQGISN------YLA WFQQKPGKVPKHLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC LQHNSYP
2-1-(1) L1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISN------YLA WFQQKPGKAPKSLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP
2-1-(1) L15 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISS------WLA WYQQKPEKAPKSLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQYNSYP
2-1-(1) L4 AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISS------ALA WYQQKPGKAPKLLIY DASSLES GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQFNSYP
2-1-(1) L18 AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGISS------ALA WYQQKPGKAPKLLIY DASSLES GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQFNSYP
2-1-(1) L5 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP
2-1-(1) L19 DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITC RASQGISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC QQANSFP
2-1-(1) L8 DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYC QQLNSYP
2-1-(1) L23 AIRMTQSPFSLSASVGDRVTITC WASQGISS------YLA WYQQKPAKAPKLFIY YASSLQS GVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDFATYYC QQYYSTP
2-1-(1) L9 AIRMTQSPSSFSASTGDRVTITC RASQGISS------YLA WYQQKPGKAPKLLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISCLQSEDFATYYC QQYYSYP
U-1-(1) L24 VIWMTQSPSLLSASTGDRVTISC RMSQGISS------YLA WYQQKPGKAPELLIY AASTLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISCLQSEDFATYYC QQYYSFP
2-1-(1) L11 AIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC RASQGIRN------DLG WYQQKPGKAPKLLIY AASSLQS GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC LQDYNYP
2-1-(U) L12 DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITC RASQSISS------WLA WYQQKPGKAPKLLIY DASSLES GVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYC QQYNSYS
VKII 3-1-(1) O11 DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLDSDDGNTYLD WYLQKPGQSPQLLIY TLSYRAS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQRIEFP
3-1-(1) O1 DIVMTQTPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLDSDDGNTYLD WYLQKPGQSPQLLIY TLSYRAS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQRIEFP
4-1-(1) A17 DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISC RSSQSLVYS-DGNTYLN WFQQRPGQSPRRLIY KVSNRDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQGTHWP
4-1-(1) A1 DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISC RSSQSLVYS-DGNTYLN WFQQRPGQSPRRLIY KVSNWDS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQGTHWP
4-1-(1) A18 DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC KSSQSLLHS-DGKTYLY WYLQKPGQSPQLLIY EVSSRFS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQGIHLP
4-1-(1) A2 DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISC KSSQSLLHS-DGKTYLY WYLQKPGQPPQLLIY EVSNRFS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQSIQLP
4-1-(1) A19 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLHS-NGYNYLD WYLQKPGQSPQLLIY LGSNRAS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQALQTP
4-1-(1) A3 DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISC RSSQSLLHS-NGYNYLD WYLQKPGQSPQLLIY LGSNRAS GVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQALQTP
4-1-(1) A23 DIVMTQTPLSSPVTLGQPASISC RSSQSLVHS-DGNTYLS WLQQRPGQPPRLLIY KISNRFS GVPDRFSGSGAGTDFTLKISRVEAEDVGVYYC MQATQFP
VKIII 6-1-(1) A27 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC RASQSVSSS-----YLA WYQQKPGQAPRLLIY GASSRAT GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSP
6-1-(1) A11 EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC GASQSVSSS-----YLA WYQQKPGLAPRLLIY DASSRAT GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC QQYGSSP
2-1-(1) L2 EIVMTQSPATLSVSPGERATLSC RASQSVSS------NLA WYQQKPGQAPRLLIY GASTRAT GIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYC QQYNNWP
2-1-(1) L16 EIVMTQSPATLSVSPGERATLSC RASQSVSS------NLA WYQQKPGQAPRLLIY GASTRAT GIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYC QQYNNWP
2-1-(1) L6 EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC RASQSVSS------YLA WYQQKPGQAPRLLIY DASNRAT GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYC QQRSNWP
2-1-(U) L20 EIVLTQSPATLSLSPGERATLSC RASQGVSS------YLA WYQQKPGQAPRLLIY DASNRAT GIPARFSGSGPGTDFTLTISSLEPEDFAVYYC QQRSNWH
6-1-(1) L25 EIVMTQSPATLSLSPGERATLSC RASQSVSSS-----YLS WYQQKPGQAPRLLIY GASTRAT GIPARFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAVYYC QQDYNLP
VKIV 3-1-(1) B3 DIVMTQSPDSLAVSLGERATINC KSSQSVLYSSNNKNYLA WYQQKPGQPPKLLIY WASTRES GVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYC QQYYSTP
VKV 2-1-(1) B2 ETTLTQSPAFMSATPGDKVNISC KASQDIDD------DMN WYQQKPGEAAIFIIQ EATTLVP GIPPRFSGSGYGTDFTLTINNIESEDAAYYFC LQHDNFP
VKVI 2-1-(1) A26 EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC RASQSIGS------SLH WYQQKPDQSPKLLIK YASQSFS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC HQSSSLP
2-1-(1) A10 EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITC RASQSIGS------SLH WYQQKPDQSPKLLIK YASQSFS GVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYC HQSSSLP
2-1-(1) A14 DVVMTQSPAFLSVTPGEKVTITC QASEGIGN------YLY WYQQKPDQAPKLLIK YASQSIS GVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLEAEDAATYYC QQGNKHP
L1
---------------------------
CDR1
-------------------------------------------
VKI 10 20 30 40
| | | |
D I Q M T Q S P S S L S A S V G D R V T I T C R A S Q S I S S Y L N W Y Q Q K P G K A P K L L I Y
O12 GAC ATC CAG ATG ACC CAG TCT CCA TCC TCC CTG TCT GCA TCT GTA GGA GAC AGA GTC ACC ATC ACT TGC CGG GCA AGT CAG AGC ATT AGC AGC TAT TTA AAT TGG TAT CAG CAG AAA CCA GGG AAA GCC CCT AAG CTC CTG ATC TAT
O2 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
O18 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..G ... ... GA. ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C
O8 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .A. ..G ... ... GA. ... ... .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C
A20 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... G.. ... ... .AT ... ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... .TT ... ... ... ... ... ...
A30 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ..A .AT G.. ... GGC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ...
L14 A.. ... ... ... ... ... ... ... ..T G.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ..G ... G.. ... ... .AT ... ... GCC ... .T. ... ... ... ... ... ... .T. ... ... .A. ... ... ...
L1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... G.. ... ... .AT ... ... GCC ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... TC. ... ... ...
L15 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... G.T ... ... ... .GG ... GCC ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... TC. ... ... ...
L4 .C. ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..T GC. ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ...
L18 .C. ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ..T GC. ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ...
L5 ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... G.T ... ... ... .GG ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L19 ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... G.T ... ... ... .GG ... GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L8 ... ... ... T.. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... G.. ... ... ..T ... ... GCC ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L23 .C. ... .G. ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ..C ... ... G.. ... ... ..T ... ... GCC ... ... ... ..A ... ... .CA ... ... ... ... ... T.C ... ...
L9 .C. ... .G. ... ... ... ... ... ... ..A T.C ... ... ... AC. ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G ... ... G.T ... ... ..T ... ... GCC ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L24 .T. ... TG. ... ... ... ... ... ... .TA ..C ... ... ... AC. ... ... ... ... ... ... .G. ..T ... ATG ... ... G.. ... ... ..T ... ... GCC ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ...
L11 .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ..A .AT G.. ... GGC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L12 ... ... ... ... ... ... ... ..T ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..T ... ..T ... .GG ..G GCC ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
A A S S L Q S G V P S R F S G S G S G T D F T L T I S S L Q P E D F A T Y Y C Q Q S Y S T P
O12 GCT GCA TCC AGT TTG CAA AGT GGG GTC CCA TCA AGG TTC AGT GGC AGT GGA TCT GGG ACA GAT TTC ACT CTC ACC ATC AGC AGT CTG CAA CCT GAA GAT TTT GCA ACT TAC TAC TGT CAA CAG AGT TAC AGT ACC CCT CC
O2 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
O18 .A. ... ... .A. ... G.. .CA ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... A.. ... ..A ..T ... ... ... ... TA. G.T .A. CT. ... ..
O8 .A. ... ... .A. ... G.. .CA ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... A.. ... ..A ..T ... ... ... ... TA. G.T .A. CT. ... ..
A20 ... ... ... .C. ... ... TCA ... ... ... ..T C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... G.. ... ... ..T ... ... ... A.. TA. A.. ... G.. ... ..
A30 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .T. ... CA. A.T ... TA. ... ..
L14 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .T. ... CA. A.T ... TA. ... ..
L1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... TA. A.T ... TA. ... ..
L15 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... TA. A.T ... TA. ... ..
L4 .A. ..C ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... TT. A.T ... TA. ... .A
L18 .A. ..C ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... TT. A.T ... TA. ... .A
L5 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... GC. A.. ... TT. ... ..
L19 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... GC. A.. ... TT. ... ..
L8 ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... CT. A.T ... TA. ... ..
L23 TA. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... .A. ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... TA. ..T ... ... ... ..
L9 ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.C ... ..G T.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... TA. ..T ... TA. ... ..
L24 ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.C ... ..G T.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... TA. ..T ... TT. ... ..
L11 ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ... ... ... ... ... ..T ... ... .T. ..A GA. ... .A. TA. ... ..
L12 .A. ..C ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..C ... ..G ... ..T ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... TA. A.T ... TAT T.. ..
L1
---------------------------------------------------
CDR1
-------------------------------------------------------------------
VKII 10 20 30 31 31a 31b 31c 31d 31e 31f 32 40
| | | | | | | | | | | |
D I V M T Q T P L S L P V T P G E P A S I S C R S S Q S L L D S D D G N T Y L D W Y L Q K P G Q S P Q L L I Y
O11 GAT ATT GTG ATG ACC CAG ACT CCA CTC TCC CTG CCC GTC ACC CCT GGA GAG CCG GCC TCC ATC TCC TGC AGG TCT AGT CAG AGC CTC TTG GAT AGT GAT GAT GGA AAC ACC TAT TTG GAC TGG TAC CTG CAG AAG CCA GGG CAG TCT CCA CAG CTC CTG ATC TAT
O1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
A17 ... G.. ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... .T. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... G.A T.C ... --- ... ... ... ... ..C ... A.T ... .TT .A. ... .G. ... ..C ..A ... ... AG. .G. ..A ..T ...
A1 ... G.. ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... .T. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... G.A T.C ... --- ... ... ... ... ..C ... A.T ... .TT .A. ... .G. ... ..C ..A ... ... AG. .G. ..A ..T ...
A18 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... C.. C.. ... --- ... ... ..G ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ..A ... ...
A2 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... .A. ... ... ... ... ... C.. C.. ... --- ... ... ..G ... ... ... T.T ... ... ... ... ... ... ..C ... C.. ... ... ... ... ... ...
A19 ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. C.. ... --- A.. ... T.. .A. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
A3 ... ... ... ... ..T ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... C.. C.. ... --- A.. ... T.. .A. ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
A23 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... TCA ..T ... ... .T. ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... G.A C.C ... --- ... ... ... ... ..C ... AGT ... CTT .A. ... .G. ... ..C ... C.. ... AGA ... ..A ..T ...
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
T L S Y R A S G V P D R F S G S G S G T D F T L K I S R V E A E D V G V Y Y C M Q R I E F P
O11 ACG CTT TCC TAT CGG GCC TCT GGA GTC CCA GAC AGG TTC AGT GGC AGT GGG TCA GGC ACT GAT TTC ACA CTG AAA ATC AGC AGG GTG GAG GCT GAG GAT GTT GGA GTT TAT TAC TGC ATG CAA CGT ATA GAG TTT CCT TC
O1 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
A17 .A. G.. ..T A.C ... .A. ... ..G ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. .C. C.C .GG ... C.
A1 .A. G.. ..T A.C T.. .A. ... ..G ... ... ... ..A ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. .C. C.C .GG ... C.
A18 GAA G.. ... AGC ... TT. ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... G.. ... C.C C.. ... C.
A2 GAA G.. ... A.C ... TT. ... ... ..G ... ..T ... ... ... ... ..C ... ... ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... A.. ... C.. C.. ... C.
A19 TT. GG. ..T A.. ... ... ..C ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... GC. C.. C.A AC. ... C.
A3 TT. GG. ..T A.. ... ... ..C ..G ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..A ... ..T ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... GC. C.. C.A AC. ... C.
A23 .A. A.. ..T A.C ... TT. ... ..G ... ... ... ..A ... ... ... ... ... G.. ..G ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ..G ... ... ... ... ... ... GC. .C. C.A ... ... CA
L1
-------------------------------
CDR1
-----------------------------------------------
VKIII 10 20 30 31 31a 32 40
| | | | | | |
E I V L T Q S P G T L S L S P G E R A T L S C R A S Q S V S S S Y L A W Y Q Q K P G Q A P R L L I Y
A27 GAA ATT GTG TTG ACG CAG TCT CCA GGC ACC CTG TCT TTG TCT CCA GGG GAA AGA GCC ACC CTC TCC TGC AGG GCC AGT CAG AGT GTT AGC AGC AGC TAC TTA GCC TGG TAC CAG CAG AAA CCT GGC CAG GCT CCC AGG CTC CTC ATC TAT
A11 ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ..G ... ... ... ... ... ...
L2 ... ..A ... A.. ... ... ... ... .C. ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L16 ... ..A ... A.. ... ... ... ... .C. ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L6 ... ... ... ... ..A ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... --- ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L20 ... ... ... ... ..A ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... --- ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
L25 ... ... ..A A.. ..A ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ...
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
G A S S R A T G I P D R F S G S G S G T D F T L T I S R L E P E D F A V Y Y C Q Q Y G S S P
A27 GGT GCA TCC AGC AGG GCC ACT GGC ATC CCA GAC AGG TTC AGT GGC AGT GGG TCT GGG ACA GAC TTC ACT CTC ACC ATC AGC AGA CTG GAG CCT GAA GAT TTT GCA GTG TAT TAC TGT CAG CAG TAT GGT AGC TCA CCT CC
A11 .A. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
L2 ... ... ... .C. ... ... ... ..T ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... C.. T.. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... AA. .A. .GG ... ..
L16 ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ..C ... C.. T.. ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... AA. .A. .GG ... ..
L6 .A. ... ... .A. ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... CG. A.C .A. .GG ... ..
L20 .A. ... ... .A. ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..A ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... CG. A.C .A. .GG .A. ..
L25 ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... C.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... G.. TA. .A. .T. ... ..
L1
---------------------------------------------------
CDR1
-------------------------------------------------------------------
VKIV 10 20 30 31 31a 31b 31c 31d 31e 31f 32 40
| | | | | | | | | | | |
D I V M T Q S P D S L A V S L G E R A T I N C K S S Q S V L Y S S N N K N Y L A W Y Q Q K P G Q P P K L L I Y
B3 GAC ATC GTG ATG ACC CAG TCT CCA GAC TCC CTG GCT GTG TCT CTG GGC GAG AGG GCC ACC ATC AAC TGC AAG TCC AGC CAG AGT GTT TTA TAC AGC TCC AAC AAT AAG AAC TAC TTA GCT TGG TAC CAG CAG AAA CCA GGA CAG CCT CCT AAG CTG CTC ATT TAC
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
W A S T R E S G V P D R F S G S G S G T D F T L T I S S L Q A E D V A V Y Y C Q Q Y Y S T P
B3 TGG GCA TCT ACC CGG GAA TCC GGG GTC CCT GAC CGA TTC AGT GGC AGC GGG TCT GGG ACA GAT TTC ACT CTC ACC ATC AGC AGC CTG CAG GCT GAA GAT GTG GCA GTT TAT TAC TGT CAG CAA TAT TAT AGT ACT CCT CC
L1
---------------------------
CDR1
-------------------------------------------
VKV 10 20 30 40
| | | |
E T T L T Q S P A F M S A T P G D K V N I S C K A S Q D I D D D M N W Y Q Q K P G E A A I F I I Q
B2 GAA ACG ACA CTC ACG CAG TCT CCA GCA TTC ATG TCA GCG ACT CCA GGA GAC AAA GTC AAC ATC TCC TGC AAA GCC AGC CAA GAC ATT GAT GAT GAT ATG AAC TGG TAC CAA CAG AAA CCA GGA GAA GCT GCT ATT TTC ATT ATT CAA
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
E A T T L V P G I P P R F S G S G Y G T D F T L T I N N I E S E D A A Y Y F C L Q H D N F P
B2 GAA GCT ACT ACT CTC GTT CCT GGA ATC CCA CCT CGA TTC AGT GGC AGC GGG TAT GGA ACA GAT TTT ACC CTC ACA ATT AAT AAC ATA GAA TCT GAG GAT GCT GCA TAT TAC TTC TGT CTA CAA CAT GAT AAT TTC CCT CT
L1
---------------------------
CDR1
-------------------------------------------
VKVI 10 20 30 40
| | | |
E I V L T Q S P D F Q S V T P K E K V T I T C R A S Q S I G S S L H W Y Q Q K P D Q S P K L L I K
A26 GAA ATT GTG CTG ACT CAG TCT CCA GAC TTT CAG TCT GTG ACT CCA AAG GAG AAA GTC ACC ATC ACC TGC CGG GCC AGT CAG AGC ATT GGT AGT AGC TTA CAC TGG TAC CAG CAG AAA CCA GAT CAG TCT CCA AAG CTC CTC ATC AAG
A10 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
A14 ..T G.. ... A.. ..A ... ... ... .CT ..C .TC ... ... ... ... GG. ... ... ... ... ... ... ... .A. ... ... G.A G.. ... ..C .AC TA. ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ..A G.C ... ... ... ... ... ...
L2 L3
----------- ----------------------
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 70 80 90
| | | | |
Y A S Q S F S G V P S R F S G S G S G T D F T L T I N S L E A E D A A T Y Y C H Q S S S L P
A26 TAT GCT TCC CAG TCC TTC TCA GGG GTC CCC TCG AGG TTC AGT GGC AGT GGA TCT GGG ACA GAT TTC ACC CTC ACC ATC AAT AGC CTG GAA GCT GAA GAT GCT GCA ACG TAT TAC TGT CAT CAG AGT AGT AGT TTA CCT CA
A10 ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
A14 ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.T ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... G.C .A. .AG CAC ... ..
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes O12 DPK9(94)/O12(88) V3b(88) 10 TCC>TTC (S>F), 86 TAC>TAT, 89 CAA>CAG, 90 CAG>TGT (Q>C), 91 AGT>GGT (S>G), 94 ACC>ACA O2 DPK9(94)/O2(88) O18 DPK1(94)/O18(89)/O18a(89) O8 DPK1(94)/O8(89) A20 DPK4(94)/A20(90) A30 A30(92) L14 DPK2(94)/L14(92) L1 HK137(68) L15 DPK7(94)/HK134(68)/HK166(68) HK101(67)/HK146(68)/HK189(68) 26 AGT>AGG (S>R) L4 Va'(71) DPK31(94)/Va(71) 35 TGC>TGA (W>*), 93 AGT>AAT (S>N) L18 Va'(71) Va''(73) 93 AGT>AAT (S>N) L5 DPK5(94)/Vb(71) Vb'(71) 96 CC>TC L19 DPK6(94)/Vb''(73) Vb'(71) 10 TCT>TCC, 74 ACT>ACC 96 CC>TC L8 DPK8(94)/Vd(71) L23 L23(92)/L23a(92) L9 Ve(71) L24 DPK10(94)/L24a(92)/V13(69) L11 DPK3(94)/L11(89) L12 HK102(67)/V1(69) L12a(92) 50 GAT>AAG (D>K), 51 GCC>GCG, 52 TCC>TCT, 54 TTG>TTA O11 DPK13(94)/O11(88) V3a(88) 34 GAC>GAT, 35 TGG>TGT (W>C), 64 GGC>GAC (G>D) O1 DPK13(94)/O1(88) A17 DPK18(94)/A17(90) A1 DPK19(94)/A1(90) A18 A18b(110) DPK28(94)/A18(90) 47 CTA>CTG, 88 TGC>TGA (C>*) A2 DPK12(94)/A2(85) A2b(109)/A2c(110) 43 CCT>TCT (P>S) A19 DPK15(94)/A19(90) A3 DPK15(94)/A3(81) A23 DPK16(94)/A23(81) A27 DPK22(94)/A27(81)/VKRF(humkv325)(77)/humkv321(75) A11 DPK20(94)/A11(81)/humkv305(75) L2 DPK21(94)/humkv328h5(84) L16 L16(92)/humkv31es(102)/humkv328h2(84)/humkv328(84) humkv329(84) 5 ACG>ATG (T>M), 94 TGG>TGA (W>*) L6 Vg(70)/38K(107) L20 Vg''(73) L25 DPK23(94)/L25(92) B3 DPK24(94)/VKIVKlobeck(72) B2 EV15(74) A26 DPK26(94)/A26(90) A10 DPK26(94)/A10(82) A14 DPK25(94)/A14(82)
-19 -10 -1
| | |
VL1 1a MAWSPLFLTLITHCAGSWA
1e MAWSPLLLTLLAHCTGSWA
1c MASFPLLLTLLTHCAGSWA
1g MAGFPLLLTLLTHCAGSWA
1b MTCSPLLLTLLIHCTGSWA
VL2 2c MAWALLLLTLLTQGTGSWA
2e MAWALLLLSLLTQGTGSWA
2a2 MAWALLLLTLLTQGTGSWA
2d MAWALLLLTLLTQGTGSWA
2b2 MAWALLLLTLLTQDTGSWA
VL3 3r MAWIPLFLGVLAYCTGSVA
3j MAWTALLLSLLAHFTGSVA
3p MAWTPLLLPLLTFCTVSEA
3a MAWIPLLLPLLTLCTGSEA
3l MAWTPLWLTLLTLCIGSVV
3h MAWTVLLLGLLSHCTGSVT
3e MAWATLLLPLLNLYTGSIA
3m MAWIPLLLPLLTLCTGSEA
2-19 MAWIPLLLPLLILCTVSVA
VL4 4c MAWVSFYLLPFIFSTGLCA
4a MAWTQLLLLFPLLLHWTGSLS
4b MAWTPLLFLTLLLHCTGSLS
VL5 5e MAWTPLLLLLLSHCTGSLS
5c MAWTPLLLLFLSHCTGSLS
5b MAWTLLLLVLLSHCTGSLS
VL6 6a MAWAPLLLTLLAHCTGSWA
VL7 7a MAWTPLFLFLLTCCPGSNS
7b MAWTPLFLFLLTCCPGSNS
VL8 8a MAWMMLLLGLLAYGSGVDS
VL9 9a MAWAPLLLTLLSLLTGSLS
VL10 10a MPWALLLLTLLTHSAVSVV
VL1 -19 -10 -1
| | |
M A W S P L F L T L I T H C A G S W A
1a ATG GCC TGG TCC CCT CTC TTC CTC ACC CTC ATC ACT CAC TGT GCA G/GG TCC TGG GCC
1e ... ... ... ..T ... ... C.. ... ..T ... C.. G.. ... ..C A.. ./.. ... ... ...
1c ... ... A.C .T. ... ... C.. ... ... ... C.. ... ... ... ... ./.. ... ... ...
1g ... ... G.C .T. ... ... C.. ... ... ... C.. ... ... ... ... ./.. ... ... ...
1b ... A.. ..C ... ... ... C.. ... ... ..T C.. .T. ... ..C A.. ./.. ... ... ...
VL2 -19 -10 -1
| | |
M A W A L L L L T L L T Q G T G S W A
2c ATG GCC TGG GCT CTG CTC CTC CTC ACC CTC CTC ACT CAG GGC ACA G/GG TCC TGG GCC
2e ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ... ... ... ... ... ./.A ... ... ..T
2a2 ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
2d ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.A ... ... ..T
2b2 ... ... ... ... ... ..G ... ... ..T ... ... ... ... .A. ... ./.. ... ... ...
VL3 -19 -10 -1
| | |
M A W I P L F L G V L A Y C T G S V A
3r ATG GCA TGG ATC CCT CTC TTC CTC GGC GTC CTT GCT TAC TGC ACA G/GA TCC GTG GCC
3j ... ..C ... .C. G.. ... C.T ..G A.. C.. ... ... C.. .TT ... ./.T ..T ... ...
3p ... ..C ... .C. ... ... C.G ... CC. C.. ..C A.. .T. ... ... ./TC ..T .A. ...
3a ... ..C ... ... ... ... C.G ... CC. C.. ..C A.. CT. ... ... ./.C ..T .A. ...
3l ... ..C ... .C. ... ... .GG ... ACT C.. ..C A.. CTT ... .T. ./.T ..T ... .TT
3h ... ..C ... .C. GT. ... C.. ... ... C.. ..C T.. C.. ... ... ./.C ..T ... A..
3e ... ... ... GC. A.A ... C.G ... CCA C.. ..C AAC CT. .A. ... ./.C ..T A.T ...
3m ... ..C ... ... ... ..A C.T ... CC. C.. ..C A.. CT. ... ... ./.C ..T .A. ...
2-19 ... ..C ... ... ... ... C.G ... CC. C.. ..C AT. CT. ... ... ./TC ..T ... ...
VL4 -19 -10 -1
| | |
M A W V S F Y L L P F I F S T G L C A
4c ATG GCC TGG GTC TCC TTC TAC CTA CTG CCC TTC ATT TTC TCC ACA G/GT CTC TGT GCT
4a ATG GCC TG. A.. CAA C.. CT. C.. CT. T.C .CT .T. C.. C.C CA. .GG ... ./.G TCT CTC T.C
4b ATG GCT TGG ACC CCA CT. C.. .T. ..C ACC .T. C.. C.C CA. .G. ... ./.G TCT CTC T.C
VL5 -19 -10 -1
| | |
M A W T P L L L L L L S H C T G S L S
5e ATG GCC TGG ACT CCT CTT CTT CTC TTG CTC CTC TCT CAC TGC ACA G/GT TCC CTC TCC
5c ... ... ... ... ... ..C ..C ... C.. T.. ... ... ... ... ... ./.. ... ... ..G
5b ... ... ... ... .T. ..C ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ...
VL6 -19 -10 -1
| | |
M A W A P L L L T L L A H C T G S W A
6a ATG GCC TGG GCT CCA CTA CTT CTC ACC CTC CTC GCT CAC TGC ACA G/GT TCT TGG GCC
VL7 -19 -10 -1
| | |
M A W T P L F L F L L T C C P G S N S
7a ATG GCC TGG ACT CCT CTC TTT CTG TTC CTC CTC ACT TGC TGC CCA G/GG TCC AAT TCT
7b ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ./.. ... ... ..C
VL8 -19 -10 -1
| | |
M A W M M L L L G L L A Y G S G V D S
8a ATG GCC TGG ATG ATG CTT CTC CTC GGA CTC CTT GCT TAT GGA TCA G/GA GTG GAT TCT
VL9 -19 -10 -1
| | |
M A W A P L L L T L L S L L T G S L S
9a ATG GCC TGG GCT CCT CTG CTC CTC ACC CTC CTC AGT CTC CTC ACA G/GG TCC CTC TCC
VL10 -19 -10 -1
| | |
M P W A L L L L T L L T H S A V S V V
10a ATG CCC TGG GCT CTG CTC CTC CTG ACC CTC CTC ACT CAC TCT GCA G/TG TCA GTG GTC
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes 1a 1a(145)/V1-11(134) 1e 1e(145)/lv1042(117)/V1-13(134) 1c 1c-a(145)/V1-6(134) 1c-b(145) -8 ACT>ATT (T>I) 1g 1g-a(145)V1-17(134) 1g-b(145) -8 ACT>ATT (T>I) 1b 1b-a(145)/lv119(117)/V1-19(134) 1b-b(145) -9 CTC>CTA 2c 2c(145)/V1-2(134) 2e 2e(145)/V1-3(134) 2a2 2a2-a(145)/V1-4(134) 2a2-b(145) -14 CTG>CTA, -13 CTC>TTC (L>F) 2d 2d(145)/V1-5(134) 2b2 2b2(145)/VL2.1(IGLV2S1)(125,126)/V1-5(134) 3r 3r(145)/VLIII.1(120)/V2-1(134) 3j 3j(145)/V2-6(134) 3p 3p(145)/V2-7(134) 3a 3a(145)/V2-11(134) 3l 3l(145)/VL3.1(IGLV3S1)(113,126)/V2-13(134) 3h 3h(145)/IGLV3S2(126)/V2-14(134) 3e 3e(145) IGLV3S3P(126)/V2-15(134) -2 ATG>GTG (M>V) 3m 3m(145) V2-17(134) -9 CTC>TTC (L>F) 2-19 V2-19(134) 4c 4c(145)/VLN.2(120)/V5-1(134) 4a 4a(145) V5-4(134) -17 CAA>CCA (Q>P), -6 TGG>TGC (W>C) 4b 4b(145)/V5-6(134) 5e 5e(145)/V4-1(134) 5c 5c(145)/V4-2(134) 5b V4-4(134) 6a 6a(145)/V1-22(134) 7a 7a(145)/VL7.1(115)/V3-2(134) 7b 7b(145)/V3-3(134) 8a 8a(145)/V3-4(134) 9a 9a(145)/V5-2(134) 10a 10a(145)/V1-20(134) The leader sequences for the germline VL genes described in Williams et al. (133) were determined by comparison of rearranged sequences derived from the peripheral blood lymphocytes of four different individuals (145). For segments 1c, 1g, 1b and 2a2 two leader sequences were cross-confirmed from different individuals. In these cases, both alleles are shown (-a and -b).
FR1 CDR1 FR2 CDR2 FR3 CDR3
---------------------- -------------- --------------- ------------ ---------------------------------- ------------
2 3 4 5 6 7 8 9
CDR1-2 Locus 1234567891234567890123 45678901abc234 567890123456789 01abcde23456 789012345678ab90123456789012345678 9012345abcde
VL1 13-7(A) 1a QSVLTQPPSVSEAPRQRVTISC SGSSSNIGNN-AVN WYQQLPGKAPKLLIY YD-----DLLPS GVSDRFSGSKSG--TSASLAISGLQSEDEADYYC AAWDDSLNG
14-7(A) 1e QSVLTQPPSVSGAPGQRVTISC TGSSSNIGAGYDVH WYQQLPGTAPKLLIY GN-----SNRPS GVPDRFSGSKSG--TSASLAITGLQAEDEADYYC QSYDSSLSG
13-7(A) 1c QSVLTQPPSASGTPGQRVTISC SGSSSNIGSN-TVN WYQQLPGTAPKLLIY SN-----NQRPS GVPDRFSGSKSG--TSASLAISGLQSEDEADYYC AAWDDSLNG
13-7(A) 1g QSVLTQPPSASGTPGQRVTISC SGSSSNIGSN-YVY WYQQLPGTAPKLLIY RN-----NQRPS GVPDRFSGSKSG--TSASLAISGLRSEDEADYYC AAWDDSLSG
13-7(A) 1b QSVLTQPPSVSAAPGQKVTISC SGSSSNIGNN-YVS WYQQLPGTAPKLLIY DN-----NKRPS GIPDRFSGSKSG--TSATLGITGLQTGDEADYYC GTWDSSLSA
VL2 14-7(A) 2c QSALTQPPSASGSPGQSVTISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY EV-----SKRPS GVPDRFSGSKSG--NTASLTVSGLQAEDEADYYC SSYAGSNNF
14-7(A) 2e QSALTQPRSVSGSPGQSVTISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY DV-----SKRPS GVPDRFSGSKSG--NTASLTISGLQAEDEADYYC CSYAGSYTF
14-7(A) 2a2 QSALTQPASVSGSPGQSITISC TGTSSDVGGYNYVS WYQQHPGKAPKLMIY EV-----SNRPS GVSNRFSGSKSG--NTASLTISGLQAEDEADYYC SSYTSSSTL
14-7(A) 2d QSALTQPPSVSGSPGQSVTISC TGTSSDVGSYNRVS WYQQPPGTAPKLMIY EV-----SNRPS GVPDRFSGSKSG--NTASLTISGLQAEDEADYYC SLYTSSSTF
14-7(A) 2b2 QSALTQPASVSGSPGQSITISC TGTSSDVGSYNLVS WYQQHPGKAPKLMIY EV-----SKRPS GVSNRFSGSKSG--NTASLTISGLQAEDEADYYC CSYAGSSTF
VL3 11-7 3r SYELTQPPSVSVSPGQTASITC SG-DK-LGDK-YAC WYQQKPGQSPVLVIY QD-----SKRPS GIPERFSGSNSG--NTATLTISGTQAMDEADYYC QAWDSSTA
11-7 3j SYELTQPLSVSVALGQTARITC GG-NN-IGSK-NVH WYQQKPGQAPVLVIY RD-----SNRPS GIPERFSGSNSG--NTATLTISRAQAGDEADYYC QVWDSSTA
11-7 3p SYELTQPPSVSVSPGQTARITC SG-DA-LPKK-YAY WYQQKSGQAPVLVIY ED-----SKRPS GIPERFSGSSSG--TMATLTISGAQVEDEADYYC YSTDSSGNH
11-7 3a SYELTQPPSVSVSLGQMARITC SG-EA-LPKK-YAY WYQQKPGQFPVLVIY KD-----SERPS GIPERFSGSSSG--TIVTLTISGVQAEDEADYYC LSADSSGTY
11-7 3l SSELTQDPAVSVALGQTVRITC QG-DS-LRSY-YAS WYQQKPGQAPVLVIY GK-----NNRPS GIPDRFSGSSSG--NTASLTITGAQAEDEADYYC NSRDSSGNH
11-7 3h SYVLTQPPSVSVAPGKTARITC GG-NN-IGSK-SVH WYQQKPGQAPVLVIY YD-----SDRPS GIPERFSGSNSG--NTATLTISRVEAGDEADYYC QVWDSSSDH
11-7 3e SYELTQLPSVSVSPGQTARITC SG-DV-LGEN-YAD WYQQKPGQAPELVIY ED-----SERYP GIPERFSGSTSG--NTTTLTISRVLTEDEADYYC LSGDEDN
11-7 3m SYELMQPPSVSVSPGQTARITC SG-DA-LPKQ-YAY WYQQKPGQAPVLVIY KD-----SERPS GIPERFSGSSSG--TTVTLTISGVQAEDEADYYC QSADSSGTY
11-7 2-19 SYELTQPSSVSVSPGQTARITC SG-DV-LAKK-YAR WFQQKPGQAPVLVIY KD-----SERPS GIPERFSGSSSG--TTVTLTISGAQVEDEADYYC YSAADNN
VL4 12-11 4c LPVLTQPPSASALLGASIKLTC TLSSEHSTY--TIE WYQQRPGRSPQYIMK VKS-DGSHSKGD GIPDRFMGSSSG--ADRYLTFSNLQSDDEAEYHC GESHTIDGQVG*
12-11 4a QPVLTQSSSASASLGSSVKLTC TLSSGHSSY--IIA WHQQQPGKAPRYLMK LEG-SGSYNKGS GVPDRFSGSSSG--ADRYLTISNLQLEDEADYYC ETWDSNT
12-11 4b QLVLTQSPSASASLGASVKLTC TLSSGHSSY--AIA WHQQQPEKGPRYLMK LNS-DGSHSKGD GIPDRFSGSSSG--AERYLTISSLQSEDEADYYC QTWGTGI
VL5 14-11 5e QPVLTQPPSSSASPGESARLTC TLPSDINVGSYNIY WYQQKPGSPPRYLLY YYS-DSDKGQGS GVPSRFSGSKDASANTGILLISGLQSEDEADYYC MIWPSNAS
14-11 5c QAVLTQPASLSASPGASASLTC TLRSGINVGTYRIY WYQQKPGSPPQYLLR YKS-DSDKQQGS GVPSRFSGSKDASANAGILLISGLQSEDEADYYC MIWHSSAS
14-11 5b QPVLTQPSSHSASSGASVRLTC MLSSGFSVGDFWIR WYQQKPGNPPRYLLY YHS-DSNKGQGS GVPSRFSGSNDASANAGILRISGLQPEDEADYYC GTWHSNSKT
VL6 13-7(B) 6a NFMLTQPHSVSESPGKTVTISC TRSSGSIASN-YVQ WYQQRPGSSPTTVIY ED-----NQRPS GVPDRFSGSIDSSSNSASLTISGLKTEDEADYYC QSYDSSN
VL7 14-7(B) 7a QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTC ASSTGAVTSGYYPN WFQQKPGQAPRALIY ST-----SNKHS WTPARFSGSLLG--GKAALTLSGVQPEDEAEYYC LLYYGGAQ
14-7(B) 7b QAVVTQEPSLTVSPGGTVTLTC GSSTGAVTSGHYPY WFQQKPGQAPRTLIY DT-----SNKHS WTPARFSGSLLG--GKAALTLSGAQPEDEAEYYC LLSYSGAR
VL8 14-7(B) 8a QTVVTQEPSFSVSPGGTVTLTC GLSSGSVSTSYYPS WYQQTPGQAPRTLIY ST-----NTRSS GVPDRFSGSILG--NKAALTITGAQADDESDYYC VLYMGSGI
VL9 12-12 9a QPVLTQPPSASASLGASVTLTC TLSSGYSNY--KVD WYQQRPGKGPRFVMR VGTGGIVGSKGD GIPDRFSVLGSG--LNRYLTIKNIQEEDESDYHC GADHGSGSNFV*
VL10 13-7(C) 10a QAGLTQPPSVSKGLRQTATLTC TGNSNNVGNQ-GAA WLQQHQGHPPKLLSY RN-----NNRPS GISERLSASRSG--NTASLTITGLQPEDEADYYC SAWDSSLSA
CDR1
-------------------------------------------------------
VL1 9 11 20 30 31 31a 31b 31c 32 40
| | | | | | | | | |
Q S V L T Q P P S V S E A P R Q R V T I S C S G S S S N I G N N A V N W Y Q Q L P G K A P K L L I Y
1a CAG TCT GTG CTG ACT CAG CCA CCC TCG GTG TCT GAA GCC CCC AGG CAG AGG GTC ACC ATC TCC TGT TCT GGA AGC AGC TCC AAC ATC GGA AAT AAT --- GCT GTA AAC TGG TAC CAG CAG CTC CCA GGA AAG GCT CCC AAA CTC CTC ATC TAT
1e ... ... ... ... ..G ... ..G ... ..A ... ... .GG ... ..A G.. ... ... ... ... ... ... ..C A.. ..G ... ... ... ... ... ..G GCA GG. TAT .A. ... C.. ... ... ... ... ..T ... ... .CA ..C ... ... ... ... ... ...
1c ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... .GG A.. ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... --- A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ..C ... ... ... ... ... ...
1g ... ... ... ... ... ... ... ... ..A .C. ... .GG A.. ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... --- TA. ... T.. ... ... ... ... ... ... ... .C. ..C ... ... ... ... ... ...
1b ... ... ... T.. ..G ... ..G ... ..A ... ... .CG ... ..A G.A ... .A. ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ..T ..G ... ... --- TA. ... TC. ... ... ... ... ... ... ... .CA ..C ... ... ... ... ..T ...
CDR2 CDR3
--------------------------- --------------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a 95b
| | | | | | | |
Y D D L L P S G V S D R F S G S K S G T S A S L A I S G L Q S E D E A D Y Y C A A W D D S L N G
1a TAT GAT GAT CTG CTG CCC TCA GGG GTC TCT GAC CGA TTC TCT GGC TCC AAG TCT GGC ACC TCA GCC TCC CTG GCC ATC AGT GGG CTC CAG TCT GAG GAT GAG GCT GAT TAT TAC TGT GCA GCA TGG GAT GAC AGC CTG AAT GGT CC
1e GG. A.C AGC AAT .G. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ..C CAG T.C .AT ..C AG. ... ... .G. ... T.
1c AG. A.. A.. .A. .G. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..
1g AGG A.. A.. .A. .G. ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ... ..
1b G.C A.. A.. AA. .GA ... ... ... A.T C.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... A.. ... .G. ... .CC ..A ... ... A.. .G. ..C ... ..C ... ... ... ..C .G. A.. ... ... AG. ... ... .G. .C. GG
CDR1
-------------------------------------------------------
VL2 9 11 20 30 31 31a 31b 31c 32 40
| | | | | | | | | |
Q S A L T Q P P S A S G S P G Q S V T I S C T G T S S D V G G Y N Y V S W Y Q Q H P G K A P K L M I Y
2c CAG TCT GCC CTG ACT CAG CCT CCC TCC GCG TCC GGG TCT CCT GGA CAG TCA GTC ACC ATC TCC TGC ACT GGA ACC AGC AGT GAC GTT GGT GGT TAT AAC TAT GTC TCC TGG TAC CAA CAG CAC CCA GGC AAA GCC CCC AAA CTC ATG ATT TAT
2e ... ... ... ... ... ... ... .G. ..A .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
2a2 ... ... ... ... ... ... ... G.. ... .T. ..T ... ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
2d ... ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... CG. ... ... ... ... ..G ... .C. ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ...
2b2 ... ... ... ... ... ... ... G.. ... .T. ..T ... ... ... ... ... ..G A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ..G A.. ... ... CT. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...
CDR2 CDR3
--------------------------- -----------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a 95b
| | | | | | | |
E V S K R P S G V P D R F S G S K S G N T A S L T V S G L Q A E D E A D Y Y C S S Y A G S N N F
2c GAG GTC AGT AAG CGG CCC TCA GGG GTC CCT GAT CGC TTC TCT GGC TCC AAG TCT GGC AAC ACG GCC TCC CTG ACC GTC TCT GGG CTC CAG GCT GAG GAT GAG GCT GAT TAT TAC TGC AGC TCA TAT GCA GGC AGC AAC AAT TTC
2e ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... T.. .C. ...
2a2 ... ... ... ..T ... ... ... ... ..T T.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. A.. ... .G. .C. C..
2d ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... .T. ... A.. A.. ... .G. .C. ...
2b2 ... ... ... ... ... ... ... ... ..T T.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..A A.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... T.. ... ... ... ..T ..T .G. .C. ...
CDR1
-------------------------------------------
VL3 9 11 20 25 27 28 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | | | | | |
S Y E L T Q P P S V S V S P G Q T A S I T C S G D K L G D K Y A C W Y Q Q K P G Q S P V L V I Y
3r TCC TAT GAG CTG ACT CAG CCA CCC TCA GTG TCC GTG TCC CCA GGA CAG ACA GCC AGC ATC ACC TGC TCT GGA GAT AAA TTG GGG GAT AAA TAT GCT TGC TGG TAT CAG CAG AAG CCA GGC CAG TCC CCT GTG CTG GTC ATC TAT
3j ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ..A ... G.. .TG ... ... ..G ... ..G ..T ... ..T GGG ... A.C ..C A.T ..A AG. ... A.. .TG CA. ... ..C ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ...
3p ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ..A ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... GC. ... CCA A.A ... ... ... .AT ... ..C ... ... ... T.. ... ... G.. ... ... ... ... ... ...
3a ... ... ... ... ..A ... ... ... ..G ... ..A ... ... .T. ... ... .TG ... ..G ... ... ... ... ... ..A GC. ... CCA A.A ... ... ... .AT ... ..C ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ..G ..A ...
3l ..T .C. ... ... ... ... GAC ..T G.T ... ..T ... G.. TTG ... ... ... .T. ..G ... ..A ... CAA ... ..C .GC C.C A.A AGC T.T ... ..A A.. ... ..C ... ... ... ... ..A ... G.. ... ..A ..T ... ... ...
3h ... ... .T. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... G.. ... ... A.. ..G ... ..G ..T ... ..T GGG ... A.C ..C A.T ..A AG. ... AG. .TG CA. ... ..C ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ... ...
3e ... ... ... ... ..A ... .T. ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ... ... ... GT. C.. ... ..A ..T ... ... GA. ... ..C ... ... ... ... ... ... G.. ... .A. T.. ..G ..A ..C
3m ... ... ... ... .TG ... ... ... ..G ... ..A ... ... ... ... ... ..G ... ..G ... ... ... ... ... ... GC. ... CCA A.G C.. ... ... .AT ... ..C ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ..G ..A ...
V2-19 ... ... ... ... ..A ... ... T.. ... ... ..A ... ..T ..G ... ... ... ... ..G ... ... ... ..A ... ... GT. C.. .CA A.A ... ... ... C.G ... .TC ... ... ... ... ... ... G.. ... ... ... ..G ..T ...
CDR2 CDR3
--------------------------- --------------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a 95b
| | | | | | | |
Q D S K R P S G I P E R F S G S N S G N T A T L T I S G T Q A M D E A D Y Y C Q A W D S S T A
3r CAA GAT AGC AAG CGG CCC TCA GGG ATC CCT GAG CGA TTC TCT GGC TCC AAC TCT GGG AAC ACA GCC ACT CTG ACC ATC AGC GGG ACC CAG GCT ATG GAT GAG GCT GAC TAT TAC TGT CAG GCG TGG GAC AGC AGC ACT GCA
3j AGG ... ... ..C ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... A.A G.. ..A ..C GG. ... ... ... ... ... ... ... ... .T. ... ... ... ... ... ...
3p G.G ..C ... ..A ..A ... ..C ... ... ... ... A.. ... ... ... ... .G. ..A ... .CA .TG ... ..C T.. ..T ... ..T ... G.. ... .TG GA. ... ..A ... ... ..C ... ... T.C T.A ACA ... ... ..T GG. AAT CAT AG
3a A.. ..C ... G.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..A ... .CA .T. .T. ..A T.. ... ... ..T ..A GT. ... ..A GAA ..C ... ... ... ... ... ... .TA T.A GCA ... ... ..T GG. A.T TAT CC
3l GGT A.A .A. ..C ... ... ... ... ... ..A ..C ... ... ... ... ... .G. ..A ..A ... ... ..T T.C T.. ... ... .CT ... G.T ... ..G GAA ... ... ... ... ... ... ... A.C T.C C.. ... ... ..T GG. AAC CAT CT
3h T.T ... ... G.C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ..C ... ... ... ... A.. GT. G.A ..C GG. ... ... ..C ... ... ... ... ... .T. ... ... ..T ..T .G. .AT CAT CC
3e G.. ... ..T G.. ... TA. C.T ..A ... ... ..A ... ... ... ..G ... .C. ..A ... ... ..G A.. ..C ... ... ... ... A.. GT. .T. A.C GAA ..C ... ... ... ... ... ... TT. T.T G.. ..T GAG GA. .A. C.
3m A.. ..C ..T G.. A.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .G. ..A ... .CA ... .T. ..G T.. ... ... ..T ..A GT. ... ..A GAA ... ... ... ... ... ... ... ..A T.A GCA ... ... ..T GG. A.T TAT CC
V2-19 A.. ..C ..T G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ... .G. ..A ... .C. ... .T. ..C T.. ... ... ... ... G.. ... .T. GA. ... ... ... ... ... ... ... T.C T.T GC. .CT GA. .A. .A. CT
CDR1
-----------------------------------------------
VL4 9 11 20 30 31 31a 32 40
| | | | | | | |
L P V L T Q P P S A S A L L G A S I K L T C T L S S E H S T Y T I E W Y Q Q R P G R S P Q Y I M K
4c CTG CCT GTG CTG ACT CAG CCC CCG TCT GCA TCT GCC TTG CTG GGA GCC TCG ATC AAG CTC ACC TGC ACC CTA AGC AGT GAG CAC AGC ACC TAC ACC ATC GAA TGG TAT CAA CAG AGA CCA GGG AGG TCC CCC CAG TAT ATA ATG AAG
4a .A. ... ... ... ... ..A T.A T.C ... ..C ... ..T .CC ... ... T.. ... G.. ... ... ... ... ..T ..G ... ... .G. ... ..T .G. ... .T. ... .C. ... C.. ..G ... CAG ... ... .A. G.. ..T .G. ..C T.G ... ...
4b .A. .T. ... ... ... ..A T.G ..C ... ..C ... ... .CC ... ... ... ... G.. ... ... ... ... ..T ..G ... ... .G. ... ... .G. ... G.. ... .C. ... C.. ..G ... CAG ... .A. .A. GG. ..T .G. ..C T.G ... ...
CDR2 CDR3
------------------------------------------- --------------------------------------------------
50 51 51a 51c 51d 51e 52 60 70 80 90 95 95a 95b 95c 95d 95e
| | | | | | | | | | | | | | | | |
V K S D G S H S K G D G I P D R F M G S S S G A D R Y L T F S N L Q S D D E A E Y H C G E S H T I D G Q V G *
4c GTT AAG AGT GAT GGC AGC CAC AGC AAG GGG GAC GGG ATC CCC GAT CGC TTC ATG GGC TCC AGT TCT GGG GCT GAC CGC TAC CTC ACC TTC TCC AAC CTC CAG TCT GAC GAT GAG GCT GAG TAT CAC TGT GGA GAG AGC CAC ACG ATT GAT GGC CAA GTC GGT TGA GC
4a C.. G.A G.. AG. ..A ... T.. .A. ... ... AG. ..A G.T ..T ... ... ... TCA ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... .TA ..G ... ... ... ..T ... T.. ... .AG ACC T.G G.. .GT .AC AC. CA
4b C.. ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... TCA ... ... ..C ... ... ... ..G ... ... ... ... A.. ... .G. ... ... ... ..G ... ... ... ..C ... T.. ... CAG ACC T.G GG. ..T GGC AT. CA
CDR1
-------------------------------------------------------
VL5 9 11 20 30 31 31a 31b 31c 32 40
| | | | | | | | | |
Q P V L T Q P P S S S A S P G E S A R L T C T L P S D I N V G S Y N I Y W Y Q Q K P G S P P R Y L L Y
5e CAG CCT GTG CTG ACT CAG CCA CCT TCC TCC TCC GCA TCT CCT GGA GAA TCC GCC AGA CTC ACC TGC ACC TTG CCC AGT GAC ATC AAT GTT GGT AGC TAC AAC ATA TAC TGG TAC CAG CAG AAG CCA GGG AGC CCT CCC AGG TAT CTC CTG TAC
5c ... G.. ... ... ... ... ..G G.. ... CT. ..T ... ... ... ... .C. ..A ... ..T ... ... ... ... ... .G. ... .G. ... ... ... ... .C. ... .GG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... CA. ... ... ... AGG
5b ... ... ... ... ... ... ... T.. ... CAT ..T ... ... T.. ... .C. ..A .T. ... ... ... ... .TG C.. AG. ... .G. T.. .G. ... ..G GA. .T. TGG ... AGG ... ... ..A ..A ... ... ... .A. ... ... C.. ... ... ... ...
CDR2 CDR3
------------------------------------------- --------------------------------------
50 51 51a 51c 51d 51e 52 60 68 68a 68b 69 70 80 90 95 95a 95b
| | | | | | | | | | | | | | | | | |
Y Y S D S D K G Q G S G V P S R F S G S K D A S A N T G I L L I S G L Q S E D E A D Y Y C M I W P S N A S
5e TAC TAC TCA GAC TCA GAT AAG GGC CAG GGC TCT GGA GTC CCC AGC CGC TTC TCT GGA TCC AAA GAT GCT TCA GCC AAT ACA GGG ATT TTA CTC ATC TCC GGG CTC CAG TCT GAG GAT GAG GCT GAC TAT TAC TGT ATG ATT TGG CCA AGC AAT GCT TCT
5c ... A.A ... ... ... ... ... CAG ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... G.. ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .AC ... .GC ... ...
5b ... C.. ... ... ..C A.. ... ... ..A ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..C ... ..A ... ... ... G.. ... ... C.G .GT ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... GGT .CA ... .AC ... ..C T.. AAG ACT CA
CDR1
---------------------------------------------------
VL6 9 11 20 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | | |
N F M L T Q P H S V S E S P G K T V T I S C T R S S G S I A S N Y V Q W Y Q Q R P G S S P T T V I Y
6a AAT TTT ATG CTG ACT CAG CCC CAC TCT GTG TCG GAG TCT CCG GGG AAG ACG GTA ACC ATC TCC TGC ACC CGC AGC AGT GGC AGC ATT GCC AGC AAC TAT GTG CAG TGG TAC CAG CAG CGC CCG GGC AGT TCC CCC ACC ACT GTG ATC TAT
CDR2 CDR3
--------------------------- ------------------------------
50 60 68 68a 68b 69 70 80 90 95
| | | | | | | | | |
E D N Q R P S G V P D R F S G S I D S S S N S A S L T I S G L K T E D E A D Y Y C Q S Y D S S N
6a GAG GAT AAC CAA AGA CCC TCT GGG GTC CCT GAT CGG TTC TCT GGC TCC ATC GAC AGC TCC TCC AAC TCT GCC TCC CTC ACC ATC TCT GGA CTG AAG ACT GAG GAC GAG GCT GAC TAC TAC TGT CAG TCT TAT GAT AGC AGC AAT CA
CDR1
-------------------------------------------------------
VL7 9 11 20 30 31 31a 31b 31c 32 40
| | | | | | | | | |
Q T V V T Q E P S L T V S P G G T V T L T C A S S T G A V T S G Y Y P N W F Q Q K P G Q A P R A L I Y
7a CAG ACT GTG GTG ACT CAG GAG CCC TCA CTG ACT GTG TCC CCA GGA GGG ACA GTC ACT CTC ACC TGT GCT TCC AGC ACT GGA GCA GTC ACC AGT GGT TAC TAT CCA AAC TGG TTC CAG CAG AAA CCT GGA CAA GCA CCC AGG GCA CTG ATT TAT
7b ... G.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .GC ... ... ... ... ..T ... ... ... ... C.T ... ..C T.. ... ... ... ... ..G ... ..C ... ..C ... ... A.. ... ... ...
CDR2 CDR3
--------------------------- -------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a
| | | | | | |
S T S N K H S W T P A R F S G S L L G G K A A L T L S G V Q P E D E A E Y Y C L L Y Y G G A Q
7a AGT ACA AGC AAC AAA CAC TCC TGG ACC CCT GCC CGG TTC TCA GGC TCC CTC CTT GGG GGC AAA GCT GCC CTG ACA CTG TCA GGT GTG CAG CCT GAG GAC GAG GCT GAG TAT TAC TGC CTG CTC TAC TAT GGT GGT GCT CAG
7b GA. ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..C ..T ..G ... .C. ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... T.. ... .C. ... A.. ... ... .G.
CDR1
-------------------------------------------------------
VL8 9 11 20 30 31 31a 31b 31c 32 40
| | | | | | | | | |
Q T V V T Q E P S F S V S P G G T V T L T C G L S S G S V S T S Y Y P S W Y Q Q T P G Q A P R T L I Y
8a CAG ACT GTG GTG ACC CAG GAG CCA TCG TTC TCA GTG TCC CCT GGA GGG ACA GTC ACA CTC ACT TGT GGC TTG AGC TCT GGC TCA GTC TCT ACT AGT TAC TAC CCC AGC TGG TAC CAG CAG ACC CCA GGC CAG GCT CCA CGC ACG CTC ATC TAC
CDR2 CDR3
--------------------------- ----------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a
| | | | | | |
S T N T R S S G V P D R F S G S I L G N K A A L T I T G A Q A D D E S D Y Y C V L Y M G S G I
8a AGC ACA AAC ACT CGC TCT TCT GGG GTC CCT GAT CGC TTC TCT GGC TCC ATC CTT GGG AAC AAA GCT GCC CTC ACC ATC ACG GGG GCC CAG GCA GAT GAT GAA TCT GAT TAT TAC TGT GTG CTG TAT ATG GGT AGT GGC ATT TC
CDR1
-----------------------------------------------
VL9 9 11 20 30 31 31a 32 40
| | | | | | | |
Q P V L T Q P P S A S A S L G A S V T L T C T L S S G Y S N Y K V D W Y Q Q R P G K G P R F V M R
9a CAG CCT GTG CTG ACT CAG CCA CCT TCT GCA TCA GCC TCC CTG GGA GCC TCG GTC ACA CTC ACC TGC ACC CTG AGC AGC GGC TAC AGT AAT TAT AAA GTG GAC TGG TAC CAG CAG AGA CCA GGG AAG GGC CCC CGG TTT GTG ATG CGA
CDR2 CDR3
----------------------------------------------- --------------------------------------------------
50 51 51a 51b 51c 51d 51e 52 60 70 80 90 95 95a 95b 95c 95d 95e
| | | | | | | | | | | | | | | | | |
V G T G G I V G S K G D G I P D R F S V L G S G L N R Y L T I K N I Q E E D E S D Y H C G A D H G S G S N F V *
9a GTG GGC ACT GGT GGG ATT GTG GGA TCC AAG GGG GAT GGC ATC CCT GAT CGC TTC TCA GTC TTG GGC TCA GGC CTG AAT CGG TAC CTG ACC ATC AAG AAC ATC CAG GAA GAG GAT GAG AGT GAC TAC CAC TGT GGG GCA GAC CAT GGC AGT GGG AGC AAC TTC GTG TAA CC
CDR1
---------------------------------------------------
VL10 9 11 20 30 31 31a 31b 32 40
| | | | | | | | |
Q A G L T Q P P S V S K G L R Q T A T L T C T G N S N N V G N Q G A A W L Q Q H Q G H P P K L L S Y
10a CAG GCA GGG CTG ACT CAG CCA CCC TCG GTG TCC AAG GGC TTG AGA CAG ACC GCC ACA CTC ACC TGC ACT GGG AAC AGC AAC AAT GTT GGC AAC CAA GGA GCA GCT TGG CTG CAG CAG CAC CAG GGC CAC CCT CCC AAA CTC CTA TCC TAC
CDR2 CDR3
--------------------------- --------------------------------------
50 60 70 80 90 95 95a 95b
| | | | | | | |
R N N N R P S G I S E R L S A S R S G N T A S L T I T G L Q P E D E A D Y Y C S A W D S S L S A
10a AGG AAT AAC AAC CGG CCC TCA GGG ATC TCA GAG AGA TTA TCT GCA TCC AGG TCA GGA AAC ACA GCC TCC CTG ACC ATT ACT GGA CTC CAG CCT GAG GAC GAG GCT GAC TAT TAC TGC TCA GCA TGG GAC AGC AGC CTC AGT GCT CA
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes 1a 1a.11.2(133)/DPL1(112)/V1-11(134) 1e 1e.10.2(133)/lv1042(117)/V1-13(134) DPL7(112) 3 GTG>GTC, 4 CTG>GTG (L>V) DPL6(112) 3 GTG>GTC, 4 CTG>GTG (L>V), 69 ACC>GCC (T>A) 1c 1c.10.2(133)/DPL2(112)/V1-16(134) 1g 1g.400B5(133)/DPL3(112) V1-17(134) 50 AGG>AGT (R>S) 1b 1b.366F5(133)/DPL5(112)/V1-19(134) lv117(128)/lv119(117) 48 ATT>ATC, 50 GAC>GAA (D>E) 2c 2c.118D9(133)/V1-2(134) 2e 2e.2.2(133)/V1-3(134) DPL12(112) 31a GGT>GGG 2a2 2a2.272A12(133)/DPL11(112)/V1-4(134) 2d 2d.29D11(133)/DPL13(112)/V1-5(134) 2b2 2b2.400B5(133) VL2.1(IGLV2S1)(113,126) 51 GTC>GGC (V>G), 95b TTC>TTAC (F>L) DPL10(112)/V1-7(134) 51 GTC>GGC (V>G) 3r 3r.9C5(133)/DPL23(112)/VLIII.1(120)/V2-1(134) 3j 3j.118D9(133)/V2-6(134) 3p 3p.81A4(133)/V2-7(134) 3a 3a.119B4(133)/V2-11(134) 3l DPL16(112)/VL3.1(IGLV3S1)(113,126)/V2-13(134) 3h IGLV3S2(126) V2-14(134) 9 TCA>TCG, 17 AAG>CAG (K>Q), 48 ATC>GTC (I>V), 50 TAT>GAT (Y>D), 92 GAC>GAT 3e* 3e.272A12(133)/V2-15(134) 3m 3m.102D1(133) V2-17(134) 5 ATG>ACA (M>T) 2-19 V2-19(134) 4c 4c.127E5(133)/DPL24(112)/VLN.2(120)/V5-1(134) 4a 4a.366F5(133) V5-4(134) 80 TTA>TTT (L>F) 4b 4b.68B6(133)/V5-6(134) 5e 5e.366F5(133)/V4-1(134) 5c 5c.366F5(133) 5c.400B5(133) 8 GCT>TCT (A>S), 25 TTG>TTA V4-2(134) 8 GCT>TCT (A>S) 5b 5b.366F5(133)/V4-4(134) 6a 6a.366F5(133)/V1-22(134) 7a 7a.2.3(133)/DPL18(112)/VL7.1(115)/V3-2(134) 7b* 7b.400B5(133)/DPL19(112) V3-3(134) 76 TCG>TTG (S>L) 8a 8a.88E1(133)/DPL21(112)/V3-4(134) 9a 9a.366F5(133)/DPL22(112) V5-2(134) 81 GAG>GAA 10a 10a.872F9(133) V1-20(134) 29 AAT>ATT (N>I), 62 TTA>TTC (L>F), 91 TGG>TTG (W>L) * Non functional alleles which have insertions and/or deletions (not indicated in amino acid and nucleotide alignments) 3e IGLV3S3P(126) 7b DPL20(112)
RF 1 RF 2 RF 3
D1 1-1 GTTGT VQLER YNWND
1-7 GITGT V*LEL YNWNY
1-20 GITGT V*LER YNWND
1-26 GIVGAT V*WELL YSGSYY
D2 2-2 RIL**YQLLY GYCSSTSCYT DIVVVPAAI
2-8 RILY*WCMLY GYCTNGVCYT DIVLMVYAI
2-15 RIL*WW*LLL GYCSGGSCYS DIVVVVAAT
2-21 SILWW*LLF AYCGGDCYS HIVVVTAI
D3 3-3 VLRFLEWLLY YYDFWSGYYT ITIFGVVII
3-9 VLRYFDWLL* YYDILTGYYN ITIF*LVII
3-10 VLLWFGELL* YYYGSGSYYN ITMVRGVII
3-16 VL*LRLGELSLY YYDYVWGSYRYT IMITFGGVIVI
3-22 VLL***WLLL YYYDSSGYYY ITMIVVVIT
D4 4-4 *LQ*L DYSNY TTVT
4-11 *LQ*L DYSNY TTVT
4-17 *LR*L DYGDY TTVT
4-23 *LRW*L DYGGNS TTVVT
D5 5-5 VDTAMV WIQLWL GYSYGY
5-12 VDIVATI WI*WLRL GYSGYDY
5-18 VDTAMV WIQLWL GYSYGY
5-24 VEMATI *RWLQL RDGYNY
D6 6-6 EYSSSS SIAAR V*QLV
6-13 GYSSSWY GIAAAG V*QQLV
6-19 GYSSGWY GIAVAG V*QWLV
D7 7-27 LTG *LG NWG
D1 1-1 GGTACAACTGGAACGAC
1-7 ....T.........T..
1-20 ....T............
1-26 ....T.GTG...G.T..TAC
D2 2-2 AGGATATTGTAGTAGTACCAGCTGCTATACC
2-8 ...........C..A.GGTGTA.........
2-15 .............G..GGT........CT..
2-21 ..C.......G..G..G---A.......T..
D3 3-3 GTATTACGATT---TTTGGAGTGGTTAT---TATACC
3-9 ..........A---...T..C.......---....A.
3-10 .......T..G---G..C.G.GA.....---....A.
3-16 ......T....ACG.....G.GA.....CGT......
3-22 .......T..G---A.A.T.........---..CTA.
D4 4-4 TGACTAC---AGTAACTAC
4-11 .......---.........
4-17 .......---G..G.....
4-23 .......GGTG......C.
D5 5-5 GTGGATACAGCTA---TGGTTAC
5-12 .......T..TGGCTAC.A....
5-18 .............---.......
5-24 ..A..G.TG....---CAA....
D6 6-6 GAGTATAGCA---GCTCGTCC
6-13 .G........GCA...G..A.
6-19 .G........GTG...G..A.
D7 7-27 CTAACTGGGGA
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes (from 5' to 3') 1-1 D1-1(139) 1-7 D1-7(139)/DM1(135) 1-20 D1-20(139) 1-26 D1-26(139) 2-2 D2-2(139) D4(136) A>G (at 2nd underlined position) (RF1 Y>C, RF2 T>A, RF3 I>M) D4-b(137) A>T (RF1 R>W), A>G (RF1 Y>C, RF2 T>A, RF3 I>M) 2-8 D2-8(139)/DLR1(135) D1(136) AA>GG (RF1 *>W, RF2 N>G, RF3 M>V) 2-15 D2-15(139)/D2(136) 2-21 D2-21(139) D3(136) C>T (RF1 silent, RF2 silent, RF3 T>I) 3-3 D3-3(139)/DXP4(135) 3-9 D3-9(139)/DXP1(135)/D21-0.5(8) 3-10 D3-10(139)/DXP'1(135) 3-16 D3-16(139) 3-22 D3-22(139)/D22-9(8) 4-4 D4-4(139)/DA4(135) 4-11 D4-11(139)/DA1(135) 4-17 D4-17(139) 4-23 D4-23(139) 5-5 D5-5(139)/DK4(135) 5-12 D5-12(139)/DK1(135) 5-18 D5-18(139) 5-24 D5-24(139) 6-6 D6-6(139)/DN4(135) 6-13 D6-13(139)/DN1(135) 6-19 D6-19(139) 7-27 D7-27(139)/DHQ52(138) The sequences D2, D3 and D4 (136) were later named DLR2, DLR3 and DLR4 respectively (135). The sequences D23-7, D21-7 and D21-10 (8) are not shown as they are superseded by the sequences of D3-3, D3-10 and D3-16 (139).
H3
------
CDR3
--------
100 110
| |
JH1 ---AEYFQHWGQGTLVTVSS
JH2 ---YWYFDLWGRGTLVTVSS
JH3 -----AFDIWGQGTMVTVSS
JH4 -----YFDYWGQGTLVTVSS
JH5 ----NWFDPWGQGTLVTVSS
JH6 YYYYYGMDVWGQGTTVTVSS
H3
-----------------------
CDR3
-------------------------------
100 110
| |
A E Y F Q H W G Q G T L V T V S S
JH1 -- --- --- --- GCT GAA TAC TTC CAG CAC TGG GGC CAG GGC ACC CTG GTC ACC GTC TCC TCA G/
JH2 -- --- --- --C TAC TGG ... ... G.T .T. ... ... .GT ... ... ... ... ..T ... ... ... ./
JH3 -- --- --- --- --. ..T GCT ..T G.T AT. ... ... ..A ..G ..A A.. ... ... ... ..T ... ./
JH4 -- --- --- --- --- -.C ... ..T G.C T.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ./
JH5 -- --- --- --- -AC A.C .GG ... G.C .C. ... ... ... ..A ... ... ... ... ... ... ... ./
JH6 AT TAC TAC TAC TAC T.C GGT A.G G.C GT. ... ... ..A ..G ... AC. ... ... ... ... ... ./
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes JH1 JH1(138) JH2 JH2(138) JH3 JH3b(141) JH3a(138) 102 ATC>GTC (I>V) JH4 JH4b(141) JH4a(138) 105 CAG>CAA JH4d(140) 98 AC>GC, 105 CAG>CAA, 106 GGA>GGG JH5 JH5b(141) JH5a(138) 102 CCC>TCC (P>S), 105 CAG>CAA JH6 JH6b(141) JH6a(138) 104 GGC>GGG JH6c(141) 99 GGT>TAC (G>Y), 105 CAA>AAA (Q>K)
L3
-
CDR3
--
100
|
JK1 WTFGQGTKVEIK
JK2 YTFGQGTKLEIK
JK3 FTFGPGTKVDIK
JK4 LTFGGGTKVEIK
JK5 ITFGQGTRLEIK
L3
-----
CDR3
----------
100
|
W T F G Q G T K V E I K
JK1 -G TGG ACG TTC GGC CAA GGG ACC AAG GTG GAA ATC AAA C/
JK2 T. .AC ..T ..T ... ..G ... ... ... C.. ..G ... ... ./
JK3 -A .TC ..T ... ... .CT ... ... ..A ... ..T ... ... ./
JK4 -. CTC ..T ... ... GG. ... ... ... ... ..G ... ... ./
JK5 -. ATC ..C ... ... ... ... ..A CGA C.. ..G ..T ... ./
Segment Sequences (ref) JK1 JK1(142) JK2 JK2(142) JK3 JK3(142) JK4 JK4(142) JK5 JK5(142)
CDR3
--
100
|
JL1 YVFGTGTKVTVL
JL2 VVFGGGTKLTVL
JL3 VVFGGGTKLTVL
JL7 AVFGGGTQLTVL
CDR3
---------
100
|
Y V F G T G T K V T V L
JL1 T TAT GTC TTC GGA ACT GGG ACC AAG GTC ACC GTC CTA G/
JL2 . GTG ..A ... ..C GGA ... ... ... C.G ... ... ... ./
JL3 . GTG ..A ... ..C GGA ... ... ... C.G ... ... ... ./
JL7 . GC. ..G ... ... GGA ..C ... C.. C.G ... ... ..C ./
Segment Sequences (ref) Nucleotide (amino acid) changes JL1 JL1(143) JL2 JL2(143) JL3 JL3a(143) JL3b(134) 96 GTG>TGG (V>W), GTA>GTG JL7 JL7(129)